Ovule a semeno jsou studovány v oboru biologie označovaném jako botanika. Ovule je ženský gametofyt, který se po oplodnění promění v semeno. Semeno na druhé straně semeno je embryonální rostlina uzavřená v ochranném vnějším obalu známém jako semenný kabát. Po oplození se jedná o produkt zrajícího vajíčka. Přestože semeno a vajíčko mají řadu vlastností; liší se také v jednom ze způsobů druhého. Mezi viditelné rozdíly mezi těmito dvěma patří:
Ovule je součástí pestíku v rostlině, a proto je umístěn přesně v květu a ve vaječníku. Semeno se naopak nachází v plně vyvinutém ovoci. Po oplodnění se z vaječníku vytvoří ovoce a z vajíčka se vytvoří semeno.
Vnější povlak ovulí i semen poskytuje ochranu proti mikroorganismům i mechanickému poškození. V případě vajíčka je vnější kryt celkovým číslem. Integument chrání jadernou tkáň vajíčka. Pro semeno působí tvrdá krycí vrstva zvaná testa jako srst, která chrání vnitřní jemné struktury semene.
Hélium je malý bod, který se nachází na povrchu ovule i semene. Rozdíl spočívá v tom, že helium v vajíčku je bod, ve kterém je tělo vajíčka připojeno k funikulu. Zcela jiným je hélium semene. Hélium v semenu je bod, ve kterém se semeno připojí k plodu. Na semeni je patrná černá jizva (helium).
Toto je semenový list. Jak je prokázáno, listy v rostlinách jsou zásadní v tom, že vyrábějí a v některých potravinách skladují. V případě semene hraje kotyledon roli při zajišťování potravy pro semeno. Kotyledon je vysoce nabitý škrobem. V ovulích ukládají parenchymatické buňky s názvem nucellus nějaké jídlo (energii), které embryonální vak používá k vývoji vajíčka..
Mikropilota je malý otvor na povrchu vajíčka nebo semene. Rozdíl mikropiloty semen a mikropiliček ovul je způsoben jejich různými funkcemi. V ovulích poskytuje mikropilota vstup pylu do struktury ovulí za účelem provádění procesu oplodnění. Pokud jde o strukturu semen, mikropilota působí jako vstupní bod vody a vzduchu, které se používají v procesu klíčení.
V semenu je embryo nejdůležitější součástí, protože jeho buňky se diferencují a rostou do různých tkání, které tvoří rostlinu. V vajíčku embryo působí jako „dům“ osmi jader, z nichž každé hraje roli v procesu oplodnění. V embryovém vaku se nachází vaječná buňka, která se spojí s pylem a vytvoří zygotu.
Lanovka je svazek vláken, které připevňují jednu část rostliny k druhé. Funicle ve vajíčku připojí vajíčko k placentě. V případě semene se lanovka označuje jako stonek. Stonek připevňuje semeno k ovoci.
Z výše uvedených ilustrací je zřejmé, že ovule a semeno mají obecné rozdíly.