Rozdíl mezi VNTR a sondou

klíčový rozdíl mezi VNTR a sondou to je VNTR je krátká nukleotidová sekvence vyskytující se jako tandemová repetice v genomu, zatímco sonda je uměle syntetizovaná krátká sekvence DNA nebo RNA, která by mohla být radioaktivně značena.

VNTR je zkratka pro tandemové opakování proměnných čísel. Je to krátká nukleotidová sekvence uspořádaná v tandemovém opakování v genomu. VNTR se přirozeně vyskytují v našem genomu. Sonda je uměle syntetizovaná krátká sekvence DNA nebo RNA. Sonda i VNTR jsou nukleové kyseliny nebo krátké nukleotidové sekvence. Mají obrovské využití v různých technikách molekulární biologie, zejména ve forenzních studiích. VNTR a sonda sdílejí některé podobnosti i rozdíly. Článek se proto pokouší zdůraznit rozdíl mezi VNTR a sondou.

OBSAH

1. Přehled a klíčový rozdíl
2. Co je to VNTR
3. Co je sonda
4. Podobnosti mezi VNTR a sondou
5. Porovnání bok po boku - VNTR vs. sonda v tabulkové formě
6. Shrnutí

Co je to VNTR?

VNTR je krátká nukleotidová sekvence, která v našem genomu existuje jako tandemové opakování. VNTR jsou přítomny v mnoha chromozomech. Kromě toho se VNTR liší od různých jedinců od délek, protože počet opakování se u VNTR různých lidí liší. V podstatě je to kvůli alelám zděděným od jejich rodičů. Proto používáme hlavně VNTR pro rodičovskou identifikaci (dědičnost) nebo pro osobní účely. Podobně je lze také použít v genetice, forenzní praxi, biologickém výzkumu a otiscích DNA. Proto je VNTR důležitým nástrojem v molekulární biologii.

Obrázek 01: VNTR

V dědičnosti analyzujeme data VNTR pomocí dvou základních principů: dědičnost a identita. Během párování dědičnosti musí mít jednotlivec odpovídající alelu každého z rodičů. Během přiřazování identity musí být obě alely VNTR přítomny na konkrétním místě genomu.

Co je sonda?

V kontextu molekulární biologie je sonda uměle syntetizovaný fragment DNA nebo RNA o délce 100 až 1000 bází. Tyto sondy můžeme radioaktivně označit. Proto je používáme při detekci cílových nukleotidových sekvencí, které jsou komplementární k sekvenci sondy. Když do vzorku přidáme sondy, dojde k hybridizaci s komplementárními sekvencemi nebo cílovými sekvencemi a usnadní nám to identifikaci cílových sekvencí. Protože sondy nesou radioaktivitu, můžeme je snadno detekovat.

Obrázek 02: Sonda

Ve forenzní vědě běžně používáme sondy v technikách profilování DNA, jako je detekce krátkých tandemových repetičních oblastí, polymorfismy délky restrikčních fragmentů a DNA otisky prstů..

Jaké jsou podobnosti mezi VNTR a sondou?

• Nukleové kyseliny jsou stavebními kameny VNTR a sondy.
• Používáme je v procesech genové identifikace.
• Také jejich obě délky jsou variabilní.
• Jsou důležitými nástroji ve forenzních studiích, otiscích DNA, genetice atd.

Jaký je rozdíl mezi VNTR a sondou?

VNTR je oblast genomu organizovaná jako tandemové repetice, zatímco sonda je krátká sekvence DNA nebo RNA syntetizovaná uměle, aby se detekovaly cílové sekvence ve vzorku. Toto je klíčový rozdíl mezi VNTR a sondou. Důležitým rozdílem mezi VNTR a sondou je také to, že na rozdíl od VNTR můžeme radioaktivně označit sondy.

Navíc VNTR většinou provádějí rodičovskou identifikaci, zatímco sondy pomáhají detekovat cílové nukleotidové sekvence ve vzorcích DNA nebo RNA, které jsou komplementární k sekvenci sondy. To je také významný rozdíl mezi VNTR a sondou.

Následující infographic uvádí více informací o rozdílu mezi VNTR a sondou.

Shrnutí - VNTR vs Probe

Běžné použití VNTR a sondy je v technikách molekulární analýzy, jako jsou forenzní studie a DNA otisky prstů. Obě sestávají z proměnných délek. Klíčový rozdíl mezi VNTR a sondou je v tom, že VNTR je oblast genomu uspořádaná s tandemovými opakováními, zatímco sonda je fragment DNA nebo RNA, který by mohl být radioaktivně značen. Kromě toho jsou VNTR přítomny v genomu. Sondy jsou však uměle syntetizovány a mohly by být radioaktivně značeny pro detekci cílových nukleotidových sekvencí ve vzorcích DNA nebo RNA, které jsou komplementární k sekvenci v sondě. Toto je shrnutí rozdílu mezi VNTR a sondou.

Odkaz:

1. „Variabilní počet tandemových opakování (VNTR) a jeho aplikace v bakteriální epidemiologii.“ Science Alert: Journal, k dispozici zde.
2. „DNA sonda.“ Nature News, Nature Publishing Group, k dispozici zde.

Obrázek se svolením:

1. „D1S80Demo“ od PaleWhaleGail na anglické Wikipedii (CC BY-SA 3.0) přes Commons Wikimedia
2. „Molekulární majáky“ (CC BY-SA 3.0) prostřednictvím Commons Wikimedia