Rozdíl mezi Alpha Helix a Beta skládaný list
Share
Klíčový rozdíl - Alpha Helix vs. Beta skládaný list
Alfa helixy a beta skládané listy jsou dvě nejčastěji se vyskytující sekundární struktury v polypeptidovém řetězci. Tyto dvě strukturální složky jsou prvními hlavními kroky v procesu skládání polypeptidového řetězce. klíčový rozdíl mezi Alpha Helix a Beta skládaný list je v jejich struktura; mají dva různé tvary, aby mohly vykonávat konkrétní práci.
Co je Alpha Helix?
Alfa helix je pravotočivá cívka aminokyselinových zbytků na polypeptidovém řetězci. Rozsah aminokyselinových zbytků se může měnit od 4 do 40 zbytků. Vodíkové vazby vytvořené mezi kyslíkem C = O skupiny na horní cívce a vodíkem N-H skupiny spodní cívky pomáhají udržovat cívku pohromadě. Vodíková vazba se vytvoří na každé čtyři aminokyselinové zbytky v řetězci výše uvedeným způsobem. Tento jednotný vzor dává určitým znakům, jako je tloušťka cívky a určuje délku každého úplného otočení podél osy šroubovice. Stabilita alfa helixové struktury závisí na několika faktorech.
O atomy v červené barvě, atomy N v modré barvě a vodíkové vazby jako zelené tečkované čáry
Co je Beta skládaný list?
Beta skládaný list, také známý jako beta list, je považován za druhou formu sekundární struktury v proteinech. Obsahuje beta řetězce, které jsou bočně spojeny minimálně dvěma nebo třemi vodíkovými vazbami páteřního řetězce, aby vytvořily zkroucený, skládaný list, jak je znázorněno na obrázku. Vlákno beta je úsek polypeptidového řetězce; jeho délka je obecně rovna 3 až 10 aminokyselinám, včetně páteře v rozšířeném potvrzení.
4-řetězcový antiparalelní fragment P listu z krystalové struktury enzymu katalázy.
a) ukazující antiparalelní vodíkové vazby (tečkované) mezi skupinami NH a CO peptidu na sousedních řetězcích. Šipky označují směr řetězce a obrysy elektronové hustoty znázorňují atomy jiné než H. O atomy jsou červené koule, atomy N jsou modré a atomy H jsou pro jednoduchost vynechány; postranní řetězce jsou zobrazeny pouze u prvního atomu postranního atomu C (zelený)
b) Okrajový pohled na střední dva řetězce β
V beta skládaných listech probíhají polypeptidové řetězce vedle sebe. Díky vlnitému vzhledu struktury dostane název „skládaný list“. Jsou spojeny vodíkovými vazbami. Tato struktura umožňuje vytvoření více vodíkových vazeb natažením polypeptidového řetězce.
Jaký je rozdíl mezi Alpha Helix a Beta skládaný list?
Struktura skládaného listu Alpha Helix a Beta
Alfa Helix:
V této struktuře je hlavní řetězec polypeptidu pevně vázán kolem imaginární osy jako spirální struktura. Je také známá jako helikoidní uspořádání peptidového řetězce.
K vytvoření alfa helixové struktury dochází, když jsou polypeptidové řetězce zkrouceny do spirály. To umožňuje, aby všechny aminokyseliny v řetězci spolu tvořily vodíkové vazby (vazba mezi molekulou kyslíku a molekulou vodíku). Vodíkové vazby umožňují spirále držet tvar spirály a dává pevnou cívku. Díky tomuto tvaru spirály je alfa spirála velmi silná.
Vodíkové vazby jsou označeny žlutými tečkami.
Skládaný list Beta:
Když se dva nebo více fragmentů polypeptidového řetězce (řetězců) překrývají jeden s druhým a vytvářejí mezi sebou řadu vodíkových vazeb, lze nalézt následující struktury. Může se to stát dvěma způsoby; paralelní a antiparalelní uspořádání.
Příklady struktury:
Alfa Helix: Nehty nebo nehty lze považovat za příklad struktury alfa spirály.
Skládaný list Beta: Struktura peří je podobná struktuře beta skládaného listu.
Vlastnosti struktury:
Alfa Helix: Ve struktuře alfa helixu existuje 3,6 aminokyselin na otáčku helixu. Všechny peptidové vazby jsou trans a planární a N-H skupiny v peptidových vazbách směřují stejným směrem, který je přibližně rovnoběžný s osou helixu. Skupiny C = O všech peptidových vazeb směřují opačným směrem a jsou rovnoběžné s osou spirály. Skupina C = O každé peptidové vazby je navázána na skupinu N-H peptidové vazby za vzniku vodíkové vazby. Všechny R- skupiny jsou směřovány ven ze spirály.
Skládaný list Beta: Každá peptidová vazba v beta skládaném listu je rovinná a má trans-konformaci. Skupiny C = O a N-H peptidových vazeb ze sousedních řetězců jsou ve stejné rovině a směřují k sobě navzájem a vytvářejí vodíkovou vazbu mezi nimi. Všechny skupiny R v kterémkoli řetězci se mohou alternativně vyskytovat nad a pod rovinou listu.
Definice:
Sekundární struktura: Je to tvar skládacího proteinu díky vodíkové vazbě mezi jeho amidem páteřního řetězce a karbonylovými skupinami.
Odkazy: „Struktura proteinu“. ChemWiki: The Dynamic Chemistry Hypertext „Sekundární struktura bílkovin: α-helices a β-Sheets“. Proteinstructures.com Salam Al Karadaghi „Organic Chemistry“. Učebnice virtuálních buněk „Beta Sheet“ .Wikipedia Image Zdvořilost: „Helix elektronová hustota myoglobin 2nrl 17-32“ autorem Dcrjsr - vlastní práce (CC BY 3.0) prostřednictvím Commons Wikimedia „Proteinová sekundární struktura“ autor: Uživatel: Bikadi (CC BY) -SA 3.0) přes Commons Wikimedia „1gwe antipar beta Sheet both“ od Dcrjsr - Vlastní práce (CC BY 3.0) přes Commons Wikimedia