Rozdíl mezi Cosmidem a Phagemidem

klíčový rozdíl mezi Cosmid a Phagemid je na typu sekvencí, které obsahuje. Kosmid obsahuje místo cos a plasmid. Jedná se tedy o hybridní vektor, zatímco fagemid je plazmid, který obsahuje počátek replikace fága F1.

Kosmidy a fagemidy se používají pro klonování, zejména pro klonování větších fragmentů DNA. Ty se široce používají zejména v klonovacích genech odpovědných za produkci různých proteinů. Kosmidy a fagemidy jsou buď replikovány samostatně jako plazmidy, nebo jsou zabaleny do virových částic a poté replikovány.

OBSAH

1. Přehled a klíčový rozdíl
2. Co je to Cosmid
3. Co je to fagemid
4. Podobnosti mezi Cosmidem a Phagemidem
5. Srovnání bok po boku - Cosmid vs Phagemid v podobě tabulky
6. Shrnutí

Co je Cosmid?

Kosmid, označovaný jako hybridní plazmid, obsahuje cos místa extrahovaná z fágových částic Lambda a plazmid. Tato místa cos jsou dlouhými fragmenty DNA s 200 bázovými páry. Mají tedy kohezivní nebo lepivé konce, které umožňují plasmidu zapadnout do virové DNA. Proto jsou stránky cos životně důležité pro balení DNA.

Existují tři stránky cos;

• cosN site - podílí se na vyřezávání řetězce DNA terminázovou aktivitou
• cosB site - zabývá se držením terminázy.
• místo cosQ - podílí se na prevenci degradace DNA DNázami.

Obrázek 01: Cosmid

Kosmidy mohou také replikovat jednovláknovou DNA nebo dvouvláknovou DNA pomocí vhodného počátku replikace. Kosmidy obvykle obsahují geny rezistentní vůči antibiotikům jako markery pro výběr transformantů. Použití kosmu jako vektoru tedy může usnadnit klonování a štěpení vektoru restrikčními enzymy může tyto fragmenty extrahovat.

Co je to Phagemid (Phasmid)?

Phagemid, také nazývaný Phasmid, je také druh hybridního vektoru. Phagemid obsahuje zvláštní počátek replikace nazvaný f1 počátek replikace. F1 původ replikačních extraktů z f1 fágu.

Fagemid může replikovat jednovláknovou i dvouvláknovou DNA. Replikace může probíhat jako plazmid při nezávislé replikaci nebo může být zabalena do fágových částic a nakonec infikovat bakteriálního hostitele E-coli. Při nakažení E-coli buněk f1 fág vyžaduje přítomnost sloupku. Proto jsou sexuální pili důležité in vitro balení fagemidů.

Jaké jsou podobnosti mezi Cosmidem a Phagemidem?

• Cosmid i Phagemid jsou klonovací vektory používané v technologii rekombinantní DNA.
• Cosmid a Phagemid mohou replikovat jednovláknovou a dvouvláknovou DNA.
• Oba mohou podstoupit nezávislou replikaci podobnou plazmidům.
• Cosmid a Phagemid mohou podstoupit in vitro balení a infikování bakteriálních buněk.
• Cosmid i Phagemid vyžadují pro klonování vhodný počátek replikace.

Jaký je rozdíl mezi Cosmidem a Phagemidem??

Cosmid vs Phagemid
Cosmid je hybridní vektor, který obsahuje místo cos a plasmid.	Fagemid je plazmid, který obsahuje počátek replikace fága F1.
Přítomnost stránek Cos
Místa Cos jsou přítomna v kosmu a jsou nezbytná pro balení in vitro.	Cos stránky chybí ve fagemidu.
Přítomnost replikace F1
Ve vesmíru může nebo nemusí být replikační původ replikace.	F1 počátek replikace je přítomen ve fagemidu.
Přítomnost genů rezistentních na antibiotika
V kosmidech jsou přítomny geny rezistentní vůči antibiotikům, které identifikují transformanty z netransformantů.	U fagemidů chybí geny rezistentní na antibiotika.
Požadavek balení In Vitro
Vyžaduje web cos.	Vyžaduje sexuální sloupek.

souhrn - Cosmid vs Fagemid

Cosmid a Phagemid jsou klonovací vektory používané v technologii rekombinantní DNA. Kosmidy jsou hybridní vektory, které obsahují speciální lepkavé konce známé jako cos stránky. in-vitro balení vyžaduje tyto stránky cos. Zatímco fagemidy jsou plasmidy, které obsahují f1 počátek replikace extrahované z f1 fágu. Kosmid i fagemid se mohou podrobit nezávislé replikaci nebo in vitro balení do bakteriálních buněk. To jsou důležité rozdíly mezi kosmidy a fagemidy.

Odkaz:

1.Qi, H, a kol. "Fagemidové vektory pro zobrazení fágů: Vlastnosti, vlastnosti a konstrukce." Journal of Molecular Biology., US National Library of Medicine, 30. března 2012. K dispozici zde 
2.Collins, J a B Hohn. "Kosmidy: typ plazmidového genového klonovacího vektoru, který je zabalitelný ve Vitru v hlavách bakterií Lambda." Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických, Národní lékařská knihovna USA, září 1978. K dispozici zde  

Obrázek se svolením:

1.'Cosmid (anglicky) 'Autor Zlir'a (CC0) přes Commons Wikimedia