Transkripce je proces převodu genetické informace uložené v kódující sekvenci DNA na sekvenci mRNA. Tento proces zahajuje specifická oblast DNA umístěná na 5 'konci transkripční jednotky. Tato oblast je známá jako promotorová oblast. Tyto promotory se obvykle nacházejí v sousedství místa začátku transkripce. Délka promotoru se pohybuje od 100 bp do 1 000 bp. Promotory se liší podle typu organismu. Eukaryotické a prokaryotické promotory se navzájem liší. V prokaryotech jsou nalezeny pouze tři typy promotorových sekvencí, a to -10 promotors, -35 promotorových a upstream elementů. v eukaryoty, existuje mnoho různých promotorových prvků, jako je TATA box, iniciační prvky, GC box, CAAT box atd. To je klíčový rozdíl mezi eukaryotickými a prokaryotními promotory.
1. Přehled a klíčový rozdíl
2. Co jsou eukaryotické promotéry
3. Co jsou prokaryotické promotéry
4. Podobnosti mezi eukaryotickými a prokaryotními promotéry
5. Srovnání bok po boku - eukaryotické vs prokaryotické promotory v tabulkové formě
6. Shrnutí
Tři hlavní porce; jádrový promotor, proximální promotor a distální promotor, společně tvoří promotor. V kontextu eukaryot se nachází mnoho promotorových prvků, které jsou vysoce sofistikované a rozmanitější než promotory. Bylo zjištěno, že v důsledku této složitosti eukaryotických promotorů má DNA schopnost skládat se zpět na sebe. To také vysvětluje skutečnost, že k účinku mnoha regulačních sekvencí dochází, i když jsou umístěny mnoho kilobáz od místa transkripce. Tyto eukaryotické promotory mají schopnost překlenout širokou škálu sekvencí DNA.
Obrázek 01: Eukaryotický promotér
Příklady některých eukaryotických promotorů jsou Pribnow box (TATA box), GC box, CAAT box atd. V kontextu TATA box, je to sekvence 5 '- TATAA -3', která je přítomna v oblasti hlavního promotoru. Do pole TATA jsou navázány proteiny transkripčního faktoru a histonové proteiny. Vazba proteinů transkripčního faktoru na TATA box napomáhá vazbě RNA polymerázy, což má za následek tvorbu transkripčního komplexu. Jednoduše řečeno, vazba těchto proteinů bude řídit proces transkripce. Tento proces bude inhibován, když se histonové proteiny naváží na TATA box. Proto je TATA box důležitým promotorovým prvkem, který zahrnuje regulaci rychlosti eukaryotické transkripce.
V prokaryotických organismech je promotor, který zahrnuje transkripci, identifikován přidruženým faktorem nazývaným sigma faktor. Sigma faktory jsou jedinečné pro různé promotorové sekvence. Proto se říká, že každý jednotlivý sigma faktor by rozpoznával jednu jádrovou promotorovou sekvenci. Toto je jedinečná vlastnost, která je přítomna v prokaryotickém transkripčním procesu. RNA polymeráza i sigma faktor společně identifikují správnou oblast promotoru a tvoří transkripční komplex.
Prokaryontní promotor obsahuje pouze tři typy promotorových prvků. Menší zapojení promotorových prvků do prokaryot je hlavním důvodem, proč je jejich transkripční proces ve srovnání s eukaryotickou transkripcí, která zahrnuje vyšší počet promotorových sekvencí, méně sofistikovaný. Ze tří promotorových prvků prokaryot jsou dvě hlavní důležité dvě krátké sekvence DNA. Tyto sekvence jsou klasifikovány podle jejich umístění. Jsou to -10 promotory nebo elementy (které jsou přítomny 10 bp proti směru od startovního místa transkripce), -35 promotory nebo elementy (které jsou přítomny 35 bp proti směru od startovního místa transkripce).
Obrázek 02: Prokaryotický promotor
Promotor -10 je ekvivalentní s eukaryotickým TATA boxem nebo Pribnow boxem a je nezbytnou součástí pro iniciaci transkripce v prokaryotech. Promotor -35 sestává ze sekvence, která je TTGACA, která se aktivně podílí na regulaci rychlosti prokaryotické transkripce.
Eukaryotické vs prokaryotické promotéry | |
Eukaryotické promotory jsou regulační sekvence, které iniciují transkripci eukaryotických organismů. | Prokaryotické promotory jsou regulační sekvence, které iniciují transkripci prokaryotních genů. |
Prvky | |
Prokaryotický promotor se skládá z upstream elementů, -10 elementů a -35 elementů. | Eukaryotický promotor sestává z Pribnowova boxu (TATA box), CAAT boxu, GC boxu a iniciátorových prvků. |
Promotor je oblast DNA, která zahrnuje zahájení procesu zvaného transkripce. Tyto promotory se obvykle nacházejí proti proudu od místa začátku transkripce. Tři hlavní části, které tvoří promotor, jsou jádrový promotor, proximální promotor a distální promotor. V souvislosti s eukaryoty existuje v promotorové oblasti mnoho propagačních prvků, které jsou vysoce sofistikované a rozmanitější než prokaryoty. Příklady některých eukaryotních promotorových elementů jsou Pribnow box (TATA box), GC box, CAAT box atd. V prokaryotech jsou dva hlavní důležité promotorové elementy, a to -10 element (to je přítomen 10 bp proti směru od startovního místa transkripce), -35 elementů (to je 35 bp proti směru od místa začátku transkripce). -10 promotor zahajuje transkripci a -35 promotor reguluje transkripci. Oba typy promotorů jsou řízeny různými regulačními sekvencemi DNA, které zahrnují enhancery, tlumiče hluku, izolátory a hraniční prvky. To je rozdíl mezi eukaryotickými a prokaryotickými promotory.
Můžete si stáhnout PDF verzi tohoto článku a použít ji pro účely offline podle citace. Stáhněte si PDF verzi zde: Rozdíl mezi eukaryotickým a prokaryotickým promotérem
1.Kde, A. „Strukturální vlastnosti promotorů: podobnosti a rozdíly mezi prokaryoty a eukaryoty.“ Nucleic Acids Research, sv. 33, ne. 10, únor 2005, str. 3165-3175., Doi: 10,1093 / nar / gki627.
2. „Pořadatelé“. Addgene. K dispozici zde
1. 'Genová struktura eukaryote 2 anotovaná' Thomas Thomas Shafee - Shafee T, Lowe R (2017). „Struktura eukaryotických a prokaryotických genů“. WikiJournal of Medicine 4 (1). DOI: 10,15347 / wjm / 2017.002. ISSN 20024436., (CC BY 4.0) prostřednictvím Commons Wikimedia
2. 'Obrázek 15 02 01' Autorem CNX OpenStax (CC BY 4.0) prostřednictvím Commons Wikimedia