Rozdíl mezi ferredoxinem a rubredoxinem

klíčový rozdíl mezi ferredoxinem a rubredoxinem je to ferredoxin má ve srovnání s rubredoxinem výrazně nižší redoxní potenciál.

Ferredoxin i rubredoxin jsou proteiny obsahující železo. Ferredoxin však můžeme nalézt v bakteriálních formách a v rostlinách, protože se jedná o protein chloroplastu. Rubredoxin je však protein, který se vyskytuje pouze u bakterií a archaea. Tyto dvě sloučeniny mají velmi podobnou strukturu.

OBSAH

1. Přehled a klíčový rozdíl
2. Co je ferredoxin
3. Co je Rubredoxin
4. Srovnání vedle sebe - Ferredoxin vs Rubredoxin v tabulkové formě
5. Shrnutí

Co je ferredoxin?

Ferredoxin je protein obsahující železo-síru. Podílí se na zprostředkování přenosu elektronů v různých metabolických reakcích. Jedná se o malé proteiny, které jsou rozpustné ve vodě a existují v chloroplastech. Atomy železa a síry v tomto proteinu jsou uspořádány v klastrech železo-síra. Mohou fungovat jako biologické kondenzátory přijímáním a vybíjením elektronů. Zde se oxidační stav atomů železa mění z +2 na +3. Působí tedy jako činidla přenášející elektrony při redoxních reakcích, ke kterým dochází v biologickém prostředí. Ve srovnání s tím je redoxní potenciál tohoto proteinu nízký. Molekula proteinu ferredoxinu může obsahovat dva, tři nebo čtyři atomy železa na molekulu proteinu. Existují tři běžné typy ferredoxinů: Fe₂S₂ ferredoxiny, Fe₄S₄ ferredoxiny a Fe₃S₄ ferredoxiny.

Hlavní úlohou ferredoxinu je alokovat vysoce energetické elektrony v chloroplastech a tyto proteiny se podílejí na distribuci elektronů potřebných pro fixaci oxidu uhličitého, redukci nitrilu, redukci sulfitu, syntézu glutamátu, cyklický tok elektronů atd..

Co je Rubredoxin?

Rubredoxin je protein obsahující železo, který se nachází v bakteriích a archaea. Je to typ proteinu s nízkou molekulovou hmotností (obvykle proteiny jsou sloučeniny s vysokou molekulovou hmotností). Na rozdíl od ferredoxinu však protein Rubredoxin neobsahuje anorganické sulfidy. Hlavní úlohou rubredoxinu je to, že se podílí na mechanismech přenosu elektronů při redoxních reakcích, které se vyskytují v biologických systémech.

Pokud uvažujeme o struktuře rubredoxinu, obsahuje centrální atom železa, který má téměř čtyřstěnnou geometrii. Čtyři skupiny, které jsou vázány k tomuto atomu železa, jsou cysteinové zbytky. Většina proteinů rubredoxinu jsou chemické látky rozpustné ve vodě. Existují však některé nerozpustné druhy, které existují jako proteiny vázané na membránu. Např. Rubredoxin-A.

Během mechanismu přenosu elektronů se oxidační stav centrálního atomu železa mění z +2 na +3. Tuto změnu v oxidačním stavu snadno poznáme, protože se barva mění z červené na bezbarvou. Během této změny zůstává kovový ion ve stavu vysoké rotace, protože je užitečné minimalizovat strukturální změny proteinu. Redukční potenciál rubredoxinu je obvykle vyšší než ferredoxin; je v rozmezí +50 mV až -50 mV.

Jaký je rozdíl mezi ferredoxinem a rubredoxinem??

Ferredoxin a rubredoxin jsou proteinové sloučeniny, které obsahují jako složky železo a síru. Klíčový rozdíl mezi ferredoxinem a rubredoxinem je v tom, že ferredoxin má ve srovnání s rubredoxinem výrazně nižší redoxní potenciál. Redoxní potenciál ferredoxinu je asi -420 mV a redoxní potenciál rubredoxinu je v rozmezí od -50 do +50 mV. Navíc ferredoxin může obsahovat dva, tři nebo čtyři atomy železa na molekulu proteinu, ale v Rubredoxinu je jeden centrální atom železa. Obě tyto molekuly však mají podobnou tetrahedrální geometrii kolem atomů železa.

Navíc ferredoxin obsahuje anorganickou síru jako složku v molekule proteinu, ale v rubredoxinu není žádná anorganická síra. Při zvažování výskytu se ferredoxin může vyskytovat jak v bakteriálních formách, tak v rostlinách, ale rubredoxin se vyskytuje v bakteriích a archaea.

Níže uvedená tabulka shrnuje rozdíl mezi ferredoxinem a rubredoxinem.

Shrnutí - Ferredoxin vs Rubredoxin

Ferredoxin a rubredoxin jsou proteinové sloučeniny, které obsahují jako složky železo a síru. Klíčový rozdíl mezi ferredoxinem a rubredoxinem je v tom, že ferredoxin má výrazně nižší redoxní potenciál ve srovnání s rubredoxinem.

Odkaz:

1. Chipperfield, J.r. "IRON | Vlastnosti a stanovení. “ Encyklopedie potravinových věd a výživy, 2003, str. 3367-3373., Doi: 10,016 / b0-12-227055-x / 00650-7.

Obrázek se svolením:

1. „3P1M.pdb1“ od vývojového týmu Jmol - Jmol (CC0) přes Commons Wikimedia
2. „PDB 1s24 EBI“ od Jawahara Swaminathana a pracovníků MSD v Evropském institutu bioinformatiky - (Public Domain) prostřednictvím Commons Wikimedia