Rozdíl mezi knockoutem genu a knockdownem

klíčový rozdíl mezi knockoutem a knockdownem je to knockout genu je technika, kde je požadovaný gen zcela odstraněn (inoperativní stav) studovat funkce genu knockdown genu je další technika, kde je požadovaný gen umlčen zkoumat roli konkrétního genu v biologickém systému.

Fungují různé genetické techniky pro zkoumání fungování genů v živých biologických systémech. Genové knockout a knockdown jsou dvě takové techniky. Tyto techniky pomáhají vědcům identifikovat funkční aspekty různých genů v živých organismech.

OBSAH

1. Přehled a klíčový rozdíl
2. Co je Gene Knockout
3. Co je Gene Knockdown
4. Podobnosti mezi knockoutem Gene a knockdownem
5. Srovnání vedle sebe - Gene Knockout vs Knockdown v tabulkové formě
6. Shrnutí

Co je Gene Knockout?

Genové knockout je genetická technika, která způsobuje, že jeden nebo více genů nefunguje v živých organismech. Toto je také proces vypínání nebo mazání genu organismu. Primární aplikací této techniky je studium genové funkce. Proces vyhodnocuje účinek ztraceného nebo odstraněného genu. Proces knockout také zahrnuje určité enzymy a techniky sestřihu.

Obrázek 01: Vyřazení genů

Existuje několik variací v technice vyřazování genů na základě počtu zapojených genů. Oni jsou dvojitý knockout (knockout dva geny), trojitý knockout (knockout tří genů) a čtyřnásobný knockout (knockout ze čtyř genů). Genový knockout je dále klasifikován do dvou skupin; heterozygotní knockouty a homozygotní knockouty.

Co je Gene Knockdown?

Genové knockdown je experimentální postup, kdy tento postup potlačuje nebo snižuje expresi konkrétního genu nebo genů organismu. Gene umlčení je běžná definice pro knockdown genu. Během tohoto postupu aktivace nebo degradace produkované mRNA zahrnuje RNA interference (RNAi), malou interferující RNA (siRNA) a krátkou vlásenkovou RNA (shRNA)..

Obrázek 02: Gene Silencing

Primární použití knockdown genu je zkoumat roli konkrétního genu v biologickém systému. Tato technika proto provádí studium onkogenů (Bcl-2 a P53) a genů, které způsobují neurologická onemocnění, virové infekce a dědičná onemocnění.

Jaké jsou podobnosti mezi Gene Knockout a Knockdown?

• Genové knockout i genové knockdown jsou genetické techniky.
• Tyto dvě techniky mohou zabránit genové expresi.
• Primárním využitím obou technik je zkoumání funkce požadovaného genu.
• Oba jsou schopni identifikovat různé stavy onemocnění (genetické).
• Oba mohou být použity pro jeden nebo více požadovaných genů.

Jaký je rozdíl mezi Gene Knockout a Knockdown?

Gene Knockout vs Knockdown
Genové knockout je v provozu genů (odstranění genů z DNA) organismu pomocí různých genetických technik.	Genové knockdown je experimentální postup pro potlačení (snížení nebo umlčení) exprese konkrétního genu nebo genů organismu.
Funkce
Usnadňuje studium funkcí genů analýzou výsledků ztraceného genu.	Usnadňuje studium onkogenů, genů, které způsobují neurologická onemocnění, virové infekce a dědičná onemocnění.
Zapojení agentů RNA
Zapojení agentů RNA je v této technice zanedbatelné.	Tento proces zahrnuje činidla jako je siRNA, shRNA a RNAi k inaktivaci mRNA.
Použití chemických látek
Používají se enzymy.	Nepoužívají se žádná taková chemická činidla.
Účinek na gen
Úplně odstraní gen z DNA.	Potlačte nebo umlčte gen.
Klasifikace
Dvojitý knockout, triple knockout a quadruple knockout a heterozygotní a homozygotní knockout jsou různé typy genových knockoutů.	Pro utlumení genů nejsou k dispozici žádné takové systémy klasifikace.

Shrnutí - Gene Knockout vs Gene Knockdown

Dvě techniky, které jsme zde probrali; genové knockout a knockdown, jsou metody zkoumání funkcí různých genů. Genové knockout úplně způsobí, že gen nefunguje, zatímco genové knockdown umlčí požadovaný gen. Oba postupy však zabraňují genové expresi. Různá činidla jsou schopna dosáhnout těchto dvou procesů. Geno knock out je typ delece, zatímco knockdown genu je druh inaktivace. To je rozdíl mezi knock-outem a knockdownem.

Odkaz:

1. Shaffer, Catherine. "Gene Knockout versus Knockdown." News-Medical.net, 12. února 2018. K dispozici zde  
2. „Gene Knockout.“ Nature News, Nature Publishing Group. K dispozici zde

Obrázek se svolením:

1.'Knockout Mice5006-300'By Maggie Bartlett, NHGRI. (Public Domain) prostřednictvím Commons Wikimedia 
2.'RNAi-simplised'By Matzke MA, Matzke AJM (2004) Výsadba semen nového paradigmatu. PLoS Biol 2 (5): e133 doi: 10.1371 / journal.pbio.0020133., (CC BY 2.5) přes Commons Wikimedia