Rozdíl mezi obecnými a specifickými transkripčními faktory

Klíčový rozdíl - obecně vs specifické transkripční faktory
 

RNA polymeráza vyžaduje transkripční faktory, aby působily na DNA templátového řetězce při syntéze mRNA. Existují různé typy transkripčních faktorů. Tyto transkripční faktory tvoří komplex s řetězcem DNA. Buď mění potvrzení templátového řetězce, nebo zvyšují afinitu enzymu RNA polymerázy k syntéze mRNA v procesu zvané transkripce. Existují dva hlavní typy transkripčních faktorů. Jsou to obecné nebo bazální transkripční faktory a specifické transkripční faktory. Obecné transkripční faktory jsou faktory používané k vytvoření před iniciačního komplexu během procesu transkripce. Jsou přítomny téměř ve všech eukaryotech a v prokaryotoch tvoří méně komplikovaný komplex. Specifické transkripční faktory jsou buď zesilovače nebo represory, což jsou specifické sekvence DNA, které aktivují nebo potlačují obecný proces transkripce. Některé specifické transkripční faktory mohou změnit samotnou sekvenci DNA. klíčový rozdíl mezi obecnými transkripčními faktory a specifickými transkripčními faktory je založeno na funkčnosti. Obecné transkripční faktory se podílejí na tvorbě pre-iniciačního komplexu transkripčního procesu, zatímco specifické transkripční faktory se účastní aktivace nebo potlačení transkripčního procesu.

OBSAH

1. Přehled a klíčový rozdíl
2. Co jsou obecné transkripční faktory
3. Jaké jsou specifické transkripční faktory
4. Podobnosti mezi obecnými a specifickými transkripčními faktory
5. Srovnání bok po boku - obecné vs. specifické transkripční faktory v tabulkové formě
6. Shrnutí

Co jsou obecné transkripční faktory?

Generál nebo Bazální transkripční faktory jsou faktory, které se podílejí na tvorbě iniciačního komplexu během transkripce. Jsou nezbytné pro proces transkripce, proto hrají při úspěšné transkripci zásadní roli. Existuje šest klíčových obecných transkripčních faktorů. Oni jsou; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIE, TFIIF a TFIIA. Při vytváření iniciačního komplexu hrají různé role.

1. TFIID - Tento transkripční faktor (TF) je zapojen do rozpoznávání promotorové sekvence (TATA box).
2. TFIIB - Komplex promotor / TFIID je rozpoznáván TFIIB. To poskytuje signál pro vazbu hlavního katalyzujícího enzymu RNA polymerázy.
3. TFIIF - Tento transkripční faktor je vázán na RNA polymerázu. TFIIF se tedy účastní procesu tím, že najme RNA polymerázu na správné místo.
4. TFIIE a TFIIH - Vazba těchto transkripčních faktorů označuje konec tvorby před-iniciačního navázání. Jejich vazba zvyšuje účinnost tvorby před-iniciačního komplexu.
5. TFIIA podporuje vazbu TFIID na TATA box.

Obrázek 01: Obecné transkripční faktory

Výše uvedené obecné transkripční faktory jsou specifické pro RNA polymerázu II, což je typ RNA polymerázy, která prodlužuje řetězec mRNA. U RNA polymerázy I a III se vyskytují obecné transkripční faktory. Obecné transkripční faktory se také mohou lišit podle typu buňky, na kterou působí.

Jaké jsou specifické transkripční faktory?

Specifické transkripční faktory jsou oblasti, které jsou také umístěny v sekvencích DNA. Většinou jde o zesilovače nebo represory. Specifické transkripční faktory jsou specifické cis-působící prvky v templátovém řetězci DNA, které podléhají transkripci. Aktivace těchto specifických zesilovačů a represorů se účastní zvyšování afinity enzymu změnou orientace molekuly DNA nebo působením jako signální regiony. Specifické transkripční faktory se také používají k vyvolání modifikací řetězce DNA templátu. Tyto modifikace zahrnují hlavně kovalentní modifikace, jako je methylace. Methylované oblasti DNA tak působí jako speciální zesilovače nebo represory transkripčního procesu.

Obrázek 02: Specifické transkripční faktory

Specifické transkripční faktory závisí na druhu druhu a nejsou běžně nalezeny ve všech eukaryotech. Tyto transkripční faktory jsou aktivovány různými metabolickými podmínkami prostřednictvím signálních transdukčních drah. Po aktivaci regulují expresi genu na transkripční úrovni.

Jaké jsou podobnosti mezi obecnými a specifickými transkripčními faktory?

• Oba procesy jsou vyžadovány v procesu transkripce.
• Oba faktory ovlivňují genovou expresi organismu.
• Oba faktory pomáhají regulovat funkci RNA polymerázy v transkripčním procesu.
• Oba faktory se vyskytují většinou v eukaryotech.

Jaký je rozdíl mezi obecnými a specifickými transkripčními faktory?

Obecný vs. specifický přepis
Obecné transkripční faktory jsou faktory, které se používají k vytvoření komplexu před zahájením transkripce během procesu transkripce.	Specifické transkripční faktory jsou buď zesilovače nebo represory, což jsou specifické sekvence DNA, které aktivují nebo potlačují obecný proces transkripce.
Typ molekuly
Obecné transkripční faktory jsou založeny na proteinu.	Specifické transkripční faktory jsou nukleotidové sekvence.
Formace
Obecné transkripční faktory tvoří před-iniciační komplex během iniciace transkripce.	Specifické transkripční faktory působí jako zesilovače nebo represory transkripce.
Typy
Existuje šest hlavních typů; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIF, TFIIE a TFIIA obecných transkripčních faktorů.	Specifické transkripční faktory jsou hlavně kategorizovány jako zesilovače a represory.

Shrnutí - Obecné vs specifické transkripční faktory

Faktory transkripce jsou nezbytné pro regulaci transkripce a jsou vyžadovány pro zvýšení účinnosti a přesnosti procesu. Faktory transkripce jsou dva hlavní typy; Obecné / základní a specifické. Obecné transkripční faktory se podílejí na tvorbě pre-iniciačního komplexu během transkripce, zatímco specifické transkripční faktory jsou regiony samotné DNA, které působí jako zesilovače nebo represory. Obecné transkripční faktory jsou založeny na proteinech a jsou vyžadovány všemi eukaryoty. Není příliš rozmanitý a zůstává jako jednotné molekuly. Specifický transkripční faktor se může široce lišit a závisí na genetickém složení jednotlivce. Toto je rozdíl mezi obecnými a specifickými transkripčními faktory.

Stáhněte si PDF verzi obecných vs specifické transkripční faktory

Můžete si stáhnout PDF verzi tohoto článku a použít ji pro účely offline podle citace. Stáhněte si prosím verzi PDF zde Rozdíl mezi obecnými a specifickými transkripčními faktory

Odkaz:

1.Pulverer, Bernd. "Transkripční faktory specifické pro DNA-vázající sekvenci." Nature News, Nature Publishing Group. K dispozici zde 
2. „Faktory transkripce - faktory specifické pro geny diferenciálně zvyšují míru transkripce.“ DNA, vázání, promotér a vazby - články JRank. K dispozici zde  
3.Orphanides, G, et al. "Obecné transkripční faktory RNA polymerázy II." Genes & Development, Cold Spring Harbor Lab. K dispozici zde  

Obrázek se svolením:

1.'Preinitační komplex 'ArneLH - vlastní práce, (CC BY-SA 3.0) přes Commons Wikimedia  
2. „Úloha transkripčního faktoru v regulaci genové exprese“ Philippe Hupé - Emmanuel Barillot, Laurence Calzone, Philippe Hupé, Jean-Philippe Vert, Andrei Zinovyev, Výpočetní systémová biologie rakoviny Chapman & Hall / CRC Mathematical & Computational Biology, 2012, (CC BY-SA 3.0) prostřednictvím Commons Wikimedia