klíčový rozdíl mezi haploskupinou a haplotypem je to haploskupina označuje skupinu podobných haplotypů, které sdílejí společného předka, zatímco haplotyp označuje sadu alel zděděných společně z generace na generaci v důsledku genetického spojení.
Gen se primárně skládá ze dvou alel. V chromozomech jsou přítomny tisíce genů. Při segregaci vykazují křížení a genetické rekombinace. Některé alely genů jsou však umístěny velmi blízko u sebe. Jednoduše řečeno, tyto alely vykazují genetickou vazbu. Není tedy pravděpodobné, že by se překřížily nebo rekombinovaly. Místo toho mají vždy tendenci přenášet společně z generace na generaci. V souladu s tím je haplotyp kombinací alel nebo sady jednoduchých nukleotidových polymorfismů přítomných na stejném chromozomu, které jsou zděděny společně podél generací od jediného rodiče. Haploskupina je skupina podobných haplotypů, které sdílejí společného předka.
1. Přehled a klíčový rozdíl
2. Co je to Haploskupina
3. Co je to Haplotyp
4. Podobnosti mezi Haploskupinou a Haplotypem
5. Porovnání bok po boku - Haploskupina vs. haplotyp v tabulkové formě
6. Shrnutí
Haploskupina je skupina podobných haplotypů, které sdílejí společného předka. Jinými slovy, haploskupina je kombinací alel přítomných v různých chromozomech, které jsou zděděny společně. Tyto alely jsou přítomny velmi blízko u sebe. Haplotypy v haploskupině mají podobné vzorce a jsou příbuznými potomky, protože mají společného předka. Je tedy snadné předpovědět haploskupinu z haplotypů.
Obrázek 01: Haploskupina
U člověka existují dvě nejčastější haploskupiny. Jsou to chromozomové haploskupiny Y, které přecházejí z otce na syna, zatímco mitochondriální DNA haploskupiny, které přecházejí z matky na dceru nebo syna.
Haplotyp je sada alel zděděných společně. Tyto alely jsou přítomny ve stejném chromozomu velmi blízko u sebe kvůli genetické vazbě. Není tedy žádná šance na rekombinaci nebo křížení. Odcházejí tedy z generace na generaci. Tyto alely mohou být alely jednoho genu nebo alely napříč více geny. Haplotyp se také může vztahovat na shluk jednoduchých nukleotidových polymorfismů přítomných na stejném chromozomu. Jedná se tedy o soubor variací DNA nebo polymorfismů zděděných společně.
Obrázek 02: Jednoduchý nukleotidový polymorfismus
Informace o haplotypech jsou užitečné při zkoumání vlivu genů na nemoci. Analýzou haplotypů a haplotypových stromů mohou genetici detekovat oblasti genomu související s onemocněním a určit vzorce genetické variace související s nemocemi. Kromě toho jsou užitečné při mapování genů při umísťování genetických markerů na správná místa na chromozomech.
Haploskupina je kombinací alel přítomných v různých chromozomech, které jsou zděděny společně. Skládá se z podobných haplotypů sdílejících společného předka. Haplotyp, na druhé straně, je sada alel nalezených ve stejném chromozomu, které jsou zděděny spolu po generace. Toto je klíčový rozdíl mezi haploskupinou a haplotypem.
Níže uvedený infographic shrnuje rozdíl mezi haploskupinou a haplotypem.
Haploskupina je skupina podobných haplotypů, které sdílejí společného předka. Haplotyp, na druhé straně, je kombinací alel nebo sady jednoduchých nukleotidových polymorfismů přítomných na stejném chromozomu, které jsou předávány podél generací od jediného rodiče. Toto je tedy klíčový rozdíl mezi haploskupinou a haplotypem. Haplotypy poskytují snadný způsob předpovídání haploskupin, protože haploskupina sestává z podobných haplotypů.
1. „Haplotyp.“ Genome.gov, k dispozici zde.
2. „Haploskupina“. Wikipedia, Wikimedia Foundation, 8. července 2019, k dispozici zde.
1. „Molekulární linie“ Wobble - vlastní práce (public domain) přes Commons Wikimedia
2. „Dna-SNP“ Podle modelu SNP Davida Ecclese (gringer) (CC BY 4.0) přes Commons Wikimedia