Rozdíl mezi vektory vložení a nahrazení

klíčový rozdíl mezi inzerčními a substitučními vektory je to, že inzerční vektor má schopnost vložit střední délky cizí DNA, zatímco náhradní vektor má schopnost pojmout větší délky cizí DNA.

Fágové vektory jsou bakteriofágy používané pro klonování. Existují dva typy fágových vektorů; jsou to inzerční vektor a náhradní vektor. Také všechny fágové vektory sestávají z neesenciálních genů. Tyto geny však musí být odstraněny z fágů, aby se usnadnily nové inzerty cizí DNA.

OBSAH

1. Přehled a klíčový rozdíl
2. Co jsou vkládací vektory
3. Co jsou náhradní vektory
4. Podobnosti mezi vektory vložení a nahrazení
5. Porovnání bok po boku - vložení vs. nahrazení vektorů v tabulkové formě
6. Shrnutí

Co je vložený vektor?

Za prvé, inzerční vektor je nejjednodušší forma klonovacích vektorů lambda. Ve skutečnosti je to typ fágového vektoru, který má jedinečné restrikční místo zavedené do vektorového genomu v poloze případné DNA. Fágová DNA dále zůstává bez odstranění. Toto neodstranění fágové DNA omezuje velikost inzertu (cizí DNA), který má být klonován ve vektoru. Tyto vektory jsou navíc užitečné při klonování a expresi cDNA. GT10, GT11 a Zap jsou příklady tohoto vektoru.

Obrázek 01: Lambda fág

Vkládací vektor se skládá z jediného rozpoznávacího místa. Primární funkcí tohoto vektoru je vývoj cDNA knihoven odvozených od eukaryotických mRNA sekvencí. Navíc může pojmout pouze délky cizí DNA v rozmezí mezi 05-11 kb. Má také jedinečné místo štěpení pro inzerci cizí DNA.

Co jsou náhradní vektory?

Náhradní vektor nebo substituční vektor je typ fágového vektoru vyvinutého odstraněním střední oblasti fragmentu fágové DNA. Požadovaný inzert cizí DNA nahrazuje fágovou DNA.

Obrázek 02: Náhradní vektor

Náhradní vektory jsou důležité při vytváření genomických knihoven, jako jsou EMBL4 a Charon40. Tyto vektory mohou pojmout větší délku cizí DNA v rozmezí mezi 08-24 kb. Výplňová oblast také sestává z genu, který činí fágový vektor neživotaschopným uvnitř bakteriálního hostitele.

Jaké jsou podobnosti mezi vektory vložení a nahrazení?

• Vkládací a náhradní vektory jsou fágové vektory.
• Oba vektory pojímají inzerty cizí DNA.
• Oba jsou nápomocní při vytváření knihoven DNA.

Jaký je rozdíl mezi vektory vložení a nahrazení?

Vložení vs Náhradní vektory
Inserční vektor je typ fágového vektoru, který má restrikční místo zavedené do fágového genomu v místě nepovinné DNA.	Náhradní vektor je typ fágového vektoru, který byl vyvinut odstraněním střední části fragmentu fágové DNA
Velikost vložených fragmentů
Délka 05-11 kb	Délka 08-24 kb
Výplňový fragment
Žádný fragment výplně	Výplňový fragment bude nahrazen cizí vložkou
Funkce
Důležité je vytvořit knihovny cDNA	Důležité při vytváření knihoven genomu
Příklady
GT10, GT11 a Zap jsou příklady	EMBL4 a Charon40 jsou příklady
Místo štěpení
Existuje jedinečné místo štěpení	Místo štěpení obsahuje geny, které nejsou nezbytné pro lytický cyklus

Shrnutí - Vložení vs Náhradní vektory

Vkládací i náhradní vektory jsou dva typy fágových vektorů. Oba vektory mají restrikční místa, která usnadňují umístění nových inzertů cizí DNA. Vkládací vektory jsou důležité při vytváření knihoven cDNA, zatímco náhradní vektory jsou důležité při vytváření genomických knihoven. Inzerční vektory navíc pojímají inzerty DNA střední délky. Náhradní vektory však mohou pojmout větší délky inzertů cizí DNA. Celkově se jedná o klíčový rozdíl mezi inzerčním a nahrazovacím vektorem.

Odkaz:

1. Hasty, P, et al. "Účinnost inzerce versus cílení na náhradní vektor se liší v různých chromozomálních lokusech." Molecular and Cellular Biology, USA National Library of Medicine, prosinec 1994, k dispozici zde.
2. „Vkládací vektory Lambda.“ Biology 335 Lecture Notes - Lambda Vectors, k dispozici zde.
3. „Náhradní vektor“. Náhradní vektor - Terminologie molekulární biologie pro náhradní vektor - GenScript, k dispozici zde.

Obrázek se svolením:

1. „Lambda fág“ od Lizanne Koch - vlastní práce s ChemBioDraw (Public Domain) přes Commons Wikimedia