Rozdíl mezi metabolomiky a metabonomiky

Key Difference - Metabolomics vs Metabonomics
 

Metabolity jsou malé molekuly účastnící se metabolických reakcí v buňkách. Metabolity zahrnují metabolické meziprodukty, hormony, sekundární metabolity, signální molekuly atd. Jsou funkční molekuly biochemických reakcí buněk. Kompletní sada metabolitů biologického vzorku nebo jediného organismu se nazývá metabolom. Metabolome je dynamická kolekce, která se mění každou sekundu v těle. Metabolomika a metabonomika jsou dva termíny vztahující se ke studiu metabolomu organismu. Klíčový rozdíl mezi metabolomikou a metabonomií je v tom metabolomika se více zajímá o normální endogenní metabolismus a metabolické profilování na buněčné nebo orgánové úrovni zatímco metabonomika se více zabývá rozšiřováním metabolického profilování informacemi o poruchách metabolismu způsobených faktory prostředí, chorobami, střevními mikroorganismy a srovnáváním metabolického profilování atd.. Metabolomika je poháněna hlavně hmotnostní spektrometrií a metabonomika používá pro analýzu metabolitů NMR spektroskopii.

OBSAH
1. Přehled a klíčový rozdíl
2. Co je metabolomika
3. Co je to metabonomie
4. Srovnání bok po boku - metabolomika vs. metabonomika
5. Shrnutí

Co je to metabolomika?

Metabolomika je studium metabolických procesů, ke kterým dochází v buňkách, biofluidech, tkáních nebo organismech. Zahrnuje identifikaci a kvantifikaci buněčných metabolitů pomocí dobrých analytických a statistických nástrojů. Metabolomika je považována za důležitou studii, protože odhaluje informace o metabolismu organismu.

Ke studiu substrátů a produktů metabolických reakcí metabolomika používá jako analytickou platformu hmotnostní spektrometrii. Hmotnostní spektrometrie odhaluje typy metabolitů a jejich koncentrace, odrážející skutečný biochemický stav buněk nebo tkání. Proto lze metabolomiku považovat za nejlepší představitele molekulárního fenotypu organismu. Metabolomika je omická technologie malých molekul organismů a porovnává se s jinými omickými studiemi; metabolomika je velmi důležitá, protože přímo odráží aktuální stav biochemické reakce buněk.

Metabolomika lze také považovat za rozšíření proteomiky, protože jsou vytvářeny v důsledku aktivity enzymů, což jsou proteiny, jak je ukázáno na následujícím obrázku.

Obrázek 01: Schéma metabolomiky

Co je to metabonomie?

Metabonomie je definována jako kvantitativní měření multiparametrických metabolických odpovědí ve specifických časech ve vztahu k patofyziologickým stresům nebo genetické modifikaci. To se obvykle používá ve studiích prováděných o výživě lidí a reakcích na léky nebo nemoci. Tento přístup propagoval Jeremy Nicholson na Imperial College v Londýně a byl používán v mnoha oborech včetně toxikologie, diagnostiky nemocí, výživy atd. Metabonomika byla historicky jednou z prvních metod, jak aplikovat rozsah systémové biologie na studie metabolismu.

Metabonomie se spíše zajímá o srovnání biochemických profilů než o identifikaci jednotlivých metabolických sloučenin v metabolomice. Proto lze metabonomii definovat jako podskupinu metabolomik. Zdůrazňuje zejména srovnání metabolických profilů různých populací s ohledem na nemoci, stres v životním prostředí, genetickou modifikaci, výživu, drogy atd., Protože metabolity jsou dobrými markery, které signalizují stav onemocnění, účinky léčiv, stres v životním prostředí, vystavení toxinům. , atd.

Metabonomické studie odhalují jak intracelulární, tak extracelulární metabolity. Používá vysoce výkonné techniky pro analýzu velkého počtu metabolitů současně a opakovaně, což umožňuje dočasné zkoumání fyziologického stavu buněk. Odhaluje také korelaci mezi metabolity a patologickým stavem organismu. Pro podporu metabonomických studií lze použít genomiku a proteomiku, protože jsou ve vzájemném vztahu, jak je uvedeno na obrázku výše.

Jaký je rozdíl mezi metabolomiky a metabonomiky?

Metabolomics vs Metabonomics
Metabolomika je studium úplné sady metabolitů organismu	Metabonomie je kvantitativní studium multiparametrických metabolických reakcí živých systémů v čase na patofyziologické podněty nebo genetickou modifikaci.
Hlavní obava
Metabolomika se více zabývá metabolickým profilováním a identifikací jednotlivých metabolitů přítomných v buňkách.	Metabonomie se více zabývá porovnáváním metabolitů nebo metabolických profilů populací ve vztahu k genetickým změnám, chorobám, stresům v životním prostředí, patologickým podnětům, drogám atd..
Informace
Metabolomika je zaměřena hlavně na endogenní metabolismus.	Metabonomie není omezena na endogenní metabolismus. Rozšiřuje se a hledá informace o poruchách metabolismu způsobených vnitřními a vnějšími faktory, jako jsou stravovací návyky, toxiny, procesy nemoci atd..
Analytické nástroje
Jako hlavní analytická platforma používá hmotnostní spektrometrii	Metabonomika používá NMR spektroskopii jako hlavní analytickou platformu.

Shrnutí - Metabolomics vs Metabonomics

Metabolom představuje kompletní sadu malých molekul nazývaných metabolity přítomné v buňce nebo v organismu. Metabolomika je studie celého metabolomu za účelem vytvoření metabolického profilu. Metabolomika umožňuje vědcům měřit skutečný fyziologický stav buňky nebo organismu. Metabonomie je součástí metabolomiky, která rozšiřuje informace o multiparametrických metabolických reakcích živých systémů na patofyziologické podněty a genetické modifikace. Metabonomie se netýká pouze individuálního metabolického profilování, jako je metabolomika; Srovnává metabolické profily ve vztahu k jiným faktorům, jako jsou environmentální zátěž, nemoci, toxiny atd. Metabolomika i metabonomika zahrnují studie metabolitů organismů k měření skutečného fyziologického stavu buněk. Proto jsou někdy tito dva považováni za synonyma, aniž by vzali v úvahu rozdíl mezi metabolomiky a metabonomiky.

Odkaz:
1. Roessner, Ute a Jairus Bowne. "O čem to všechno je metabolomika." BioTechniques - Co je to metabolomika? N.p., duben 2009. Web. 24. dubna 2017
2. Jeremy J. Ramsden (1). "Metabolomika a metabonomika." Springer. Springer London, 1. ledna 1970. Web. 25. dubna 2017

Obrázek se svolením:
1. „Schéma metabolomiky“ od Lmaps (diskuse) - vlastní práce (CC BY-SA 3.0) přes Commons Wikimedia