Rozdíl mezi minisatelitem a mikrosatelitem

Key Difference - Minisatellite vs. Microsatellite
 

Opakující se DNA jsou nukleotidové sekvence opakující se znovu a znovu v genomu organismů. Repetitivní DNA představuje významnou část genomické DNA a existují tři hlavní typy nazvané tandemové opakování, terminální opakování a přerušovaná opakování. Tandemové opakování jsou vysoce opakované sekvence, které leží vedle sebe bez přerušení. V genomu obratlovců existují tři hlavní typy tandemových opakování. Jsou to satelitní DNA, mikrosatelitní DNA a minisatelitní DNA. Minisatellit je část vysoce opakované DNA, která se skládá ze série opakujících se sekvencí složených z 10 až 100 párů bází. Microsatellite je část opakující se DNA, která se skládá z krátkých opakujících se sekvencí složených z 1 až 9 párů bází. Klíčovým rozdílem mezi minisatelitem a mikrosatelitem je proto velikost nebo délka opakující se sekvence.

OBSAH

1. Přehled a klíčový rozdíl
2. Co je minisatelit
3. Co je Microsatellite
4. Podobnosti mezi minisatelitem a mikrosatelitem
5. Porovnání bok po boku - Minisatellite vs. Microsatellite v tabulkové formě
6. Shrnutí

Co je minisatelit?

Minisatelitní DNA je část DNA, která obsahuje řadu krátkých opakujících se sekvencí DNA, které mají délku 10 až 60 párů bází. Minisatelity jsou také označovány jako proměnné číslo tandemové opakování (VNTR). Minisatelity jsou často zaměňovány s mikrosatelity. Minisatelit a mikrosatelit se však nyní liší podle velikosti opakující se sekvence vědci.

Minisatelity jsou v lidském genomu vidět na více než 1000 místech. Tyto krátké sekvence jsou bohaté na G a C. Počet opakování v daném minisatelitu se mezi jednotlivci značně liší.

První lidský minisatelit byl identifikován A. R. Wymanem a R. Whiteem v roce 1980. Později Alec Jeffreys objevil extrémní polymorfismus počtu kopií minisatelitů mezi organismy. Tyto objevy učinily minisatellity jako ideální markery pro DNA fingerprinting, analýzu vazeb a populační studie. Minisatelity také přispívají k regulaci genové exprese, transkripce, alternativního sestřihu atd.

Co je Microsatellite?

Microsatellite je část DNA, která má jednoduché opakování sekvence 1 až 10 párů bází. Mikrosatelity jsou také nazývány opakování krátkých sekvencí (SSR) nebo jednoduché tandemové opakování (STR).  Existují dva typy mikrosatelitů, které se nazývají jednoduché mikrosatelity a složené mikrosatelity. Jednoduché mikrosatelity sestávají pouze z jednoho typu opakujících se sekvencí. Složené mikrosatelity sestávají z více než jednoho typu opakování. Mikrosatelity mají nejčastěji poly A / T oblasti. Mikrosatelity jsou v eukaryotických genomech hojné a hojné.

Podobně jako u minisatelitů vykazují mikrosatelity také polymorfismus mezi jednotlivci. Počet opakování pro daný mikrosatelit se u jednotlivých jedinců liší. Proto mohou být mikrosatelity také použity jako genetické markery při DNA otiscích prstů. Polymorfismus mikrosatelitů lze snadno identifikovat pomocí PCR a gelové elektroforézy. Přilehlá oblast mikrosatelitu je u příbuzných druhů vysoce konzervativní.

Jaké jsou podobnosti mezi minisatelity a mikrosatelity?

• Minisatelity a mikrosatelity jsou nekódující sekvence DNA.
• Oba jsou tandemové opakování.
• Oba sestávají z vysoce se opakujících sekvencí.
• Oba mohou být použity jako silné genetické markery pro DNA fingerprinting.

Jaký je rozdíl mezi Minisatellite a Microsatellite?

Minisatellite vs. Microsatellite
Minisatelity jsou tandemové repetice s délkou opakování monomerů 10 až 100 párů bází.	Mikrosatelity jsou krátké tandemové repetice, které se skládají z 1 až 9 párů bází opakujících se monomerů.
Velikost opakující se sekvence
Minisatellit má opakující se sekvence 10 až 100 párů bází.	Mikrosatelit má krátké sekvence 1 až 9 párů bází.
Běžné základy
Minisatelity jsou bohaté na báze G a C.	Mikrosatelity jsou bohaté na báze A a T.
Ostatní jména
Minisatelity jsou známé také jako tandemové opakování s proměnným počtem (VNTR).	Mikrosatelity jsou známé také jako opakování krátkých sekvencí (SSR) nebo jednoduché tandemové opakování (STR).

Shrnutí - Minisatellite vs. Microsatellite

Minisatellit a mikrosatelit jsou dva typy tandemových opakování. Rozlišují se na základě počtu bází v opakující se sekvenci nebo velikosti sekvence. Minisatellite má opakující se sekvenci o délce 10 až 100 bazických párů, zatímco mikrosatelit má opakující se sekvenci o délce 1 až 9 bazických párů. To je hlavní rozdíl mezi minisatelitem a mikrosatelitem. Počet opakujících se sekvencí v minisatelitech a mikrosatelitech se u jednotlivců velmi liší. Jak minisatelity, tak mikrosatelity jsou silnými DNA markery pro analýzu genetické variace uvnitř populací druhů a mezi nimi.

Stáhněte si PDF verzi Minisatellite vs. Microsatellite

Můžete si stáhnout PDF verzi tohoto článku a použít ji pro účely offline podle citačních poznámek. Stáhněte si PDF verzi zde Rozdíl mezi minisatelity a mikrosatelity.

Reference:

1.Haneef, Deena T Kochunni Jazir. "Velké rozdíly." Rozdíl mezi minisatelitem a mikrosatelitem. N.p., n.d. Web. K dispozici zde. 6. července 2017.
2.Vieira, Maria Lucia Carneiro, Luciane Santini, Augusto Lima Diniz a Carla De Freitas Munhoz. "Mikrosatelitní markery: co znamenají a proč jsou tak užitečné." Genetika a molekulární biologie. Sociedade Brasileira de Genética, 2016. Web. K dispozici zde. 7. července 2017.

Obrázek se svolením:

1. „VNTRexample“ od Madelyndotson - vlastní práce (CC BY-SA 4.0) přes Commons Wikimedia