Rozdíl mezi motivem a doménou

klíčový rozdíl mezi motivem a doménou je, že motiv není nezávisle stabilní, zatímco doména je nezávisle stabilní.

Bílkoviny jsou důležité biologické makromolekuly přítomné v našem těle. Na druhé straně genetický kód genu rozhodne o aminokyselinové sekvenci proteinu. Kromě toho proteiny mají primární, sekundární a terciární struktury. Primární struktura je aminokyselinová sekvence polypeptidového řetězce. Když se polypeptidové řetězce vzájemně skládají, tvoří sekundární strukturu proteinu. K sekundárním strukturám patří alfa helixy, beta listy a supersekundární struktury. Některé skupiny supersekundárních prvků jsou známé jako proteinové motivy. Terciární struktura proteinu se týká jeho trojrozměrné struktury, která rozhoduje o funkci proteinu. Doména je složená část molekuly proteinu, která je kulovitá a má diskrétní funkci. Je to základní funkční a trojrozměrná struktura proteinu.

OBSAH

1. Přehled a klíčový rozdíl
2. Co je motiv?
3. Co je to doména
4. Podobnosti mezi motivem a doménou
5. Srovnání bok po boku - motiv vs. doména v tabulkové formě
6. Shrnutí

Co je motiv??

Motiv je určité seskupení super sekundárních prvků proteinů, jako jsou alfa helixy a beta struktury. Jsou to nějaké vzory přítomné v různých proteinech. Motivy popisují skládací vzorce sekundárních strukturních prvků a jejich vzájemné působení. Tyto skládací vzory se stabilizují podobnými vazbami, které jsou přítomny v terciárních strukturách. Nejsou však tak složité jako terciární struktury.

Obrázek 01: Motiv

Jsou to jednoduché kombinace sekundárních struktur proteinů. Samotný motiv není stabilní. Dále motivy vysvětlují strukturu proteinu, ale nepředpovídají funkci proteinu. Příklady proteinových motivů jsou beta-alfa-beta motiv, řecký klíčový motiv, Beta barel, Beta-meandrový motiv atd..

Co je to doména?

Doména je základní, funkční a trojrozměrná jednotka proteinu. Provádí určitou funkci. Jeden protein může mít několik odlišných domén. Každá doména je nezávislá jednotka. Je to globulární struktura. Je zodpovědný za konkrétní funkci nebo interakci. Domény lze použít k hypotéze funkce necharakterizovaného proteinu. Při analýze proteinu je nezbytné vzít v úvahu, protože domény jsou funkčními jednotkami proteinu.

Obrázek 02: Tři různé domény pyruvát kinázy

Domény jsou velmi stabilní a kompaktní struktury. Lze je snadno odlišit od ostatních regionů. Pyruvát kináza má tři odlišné domény, jak je znázorněno na obrázku 02. Délka domény se může lišit a průměrná délka je 100 aminokyselin. Každá doména obsahuje hydrofobní jádro vytvořené ze sekundárních strukturálních jednotek. Několik domén společně vytváří terciární strukturu proteinu.

Jaké jsou podobnosti mezi motivem a doménou?

• Motiv a doména jsou jednotky přítomné v samotných proteinových molekulách.
• Jsou užitečné při klasifikaci proteinových rodin.

Jaký je rozdíl mezi motivem a doménou?

Motiv je určité seskupení super sekundárních prvků proteinů, jako jsou alfa helixy a beta struktury, zatímco doména je funkční jednotka proteinu. Kromě toho je motiv sekundární strukturou, zatímco doména je zodpovědná za terciární strukturu proteinu. Doména je navíc na rozdíl od motivu nezávislou jednotkou. Doména také zobrazuje funkci proteinu, zatímco motiv není. To jsou hlavní rozdíly mezi motivem a doménou. Níže uvedený infographic představuje rozdíl mezi motivem a doménou v podobě tabulky.

Shrnutí - Motif vs Domain

Motiv je uspořádání sekundárních struktur proteinové molekuly. Na rozdíl od domény obvykle není sám o sobě stabilní. Doména je nezávisle stabilní struktura proteinu. Může se tedy jednat o část nebo celou molekulu proteinu. Je to trojrozměrná základní funkční jednotka proteinu. Navíc má funkci a je nezávislou jednotkou. Motiv může být součástí domény. Doména však nemůže být součástí motivu. To je rozdíl mezi motivem a doménou.

Odkaz:

1. „Proteinová doména.“ Wikipedia, Wikimedia Foundation, 31. července 2018. K dispozici zde

Obrázek se svolením:

1. "Klíčový motiv proteinu toxinu anthraxu" autorem NatelewisDerivativní práce (CC BY-SA 3.0) prostřednictvím Commons Wikimedia
2. „proteinové domény pyruvát kinázy“ Thomas Splettstoesser - vlastní práce, (CC BY-SA 3.0) přes Commons Wikimedia