Rozdíl mezi oligonukleotidem a polynukleotidem

Klíčový rozdíl - oligonukleotid vs. polynukleotid
 

Nukleotidy jsou základní strukturální jednotky, které syntetizují komplexní polymerní formy DNA (nukleová kyselina deoxyribóza) a RNA (nukleová kyselina ribóza). Nukleotidy jsou organické molekuly. Skládají se ze tří základních podjednotek: dusíkatá báze, pentózový cukr (ribóza / deoxyribóza) a fosfátová skupina. DNA a RNA syntetizovaná z nukleotidů fungují jako podstatné biomolekuly v živém systému. Existuje mnoho typů nukleotidů, včetně oligonukleotidů a polynukleotidů. Oligonukleotidy jsou krátké segmenty DNA a RNA s jedním nebo více nukleotidovými monomery zatímco polynukleotidy jsou biopolymery s 13 nebo více nukleotidovými monomery. Toto je klíčový rozdíl mezi oligonukleotidy a polynukleotidy.

OBSAH

1. Přehled a klíčový rozdíl
2. Co je to oligonukleotid
3. Co je to polynukleotid
4. Podobnosti mezi oligonukleotidem a polynukleotidem
5. Porovnání vedle sebe - oligonukleotid vs. polynukleotid v tabulkové formě
6. Shrnutí

Co je to oligonukleotid?

Krátké segmenty molekul DNA a RNA jsou známé jako oligonukleotidy. Jsou široce používány v oborech forenzní vědy, genetiky a výzkumu. Oligonukleotidy mohou být produkovány procesem známým jako chemická syntéza na pevné fázi prováděná uvnitř laboratoře. Jsou produkovány jako jednořetězcové molekuly se sekvencí, která je specifikována pro konkrétní funkci a je důležitým aspektem v souvislosti s PCR (polymerázová řetězová reakce), DNA microarrays, technikou Southern blot, FISH (fluorescenční hybridizace in situ), syntézou umělé geny, produkce knihoven DNA / RNA a působí jako molekulární sondy.

Obrázek 01: Oligonukleotid

Oligonukleotidy se přirozeně vyskytují jako mikroRNA, malé molekuly RNA, které regulují genovou expresi. Oligonukleotidy mohou být také přítomny v důsledku katabolismu větších nukleových kyselin. Celá molekula je charakterizována a vyvíjena sekvencí nukleotidových zbytků. Oligonukleotidy složené z fragmentů DNA se používají během PCR, což je proces, při kterém lze nepatrné množství DNA amplifikovat do milionů kopií. Oligonukleotidy zde působí jako primery, které pomáhají při fungování DNA polymerázy. Chemicky nebo přirozeně modifikovaný nukleosid známý jako fosforamidit působí jako hlavní složka při syntéze oligonukleotidů. Syntéza oligonukleotidového řetězce probíhá od 3 'konce do 5' konce v cyklické dráze označované jako syntetický cyklus. Po dokončení jednoho syntetického cyklu se do rostoucího řetězce přidá jediný nukleotid.

Co je to polynukleotid?

Polynukleotidová molekula sestává z 13 nebo více nukleotidových monomerů a je označována jako biopolymer. Monomery jsou kovalentně navázány na nukleotidový řetězec. DNA a RNA jsou příklady polynukleotidů. Nejjednodušší polynukleotid v živém systému je RNA (Ribonucleic Acid), která obsahuje pentózový cukr ribosu. RNA je složena z jednovláknového polynukleotidu. Molekula se skládá ze čtyř dusíkatých bází, adeninu, guaninu, cytosinu a uracilu. RNA je mnoha různých typů: mRNA (messenger RNA), rRNA (ribozomální RNA), tRNA (transfer RNA).

Nukleová kyselina deoxyribózy (DNA) je další polynukleotid, který se skládá z pentózového cukru deoxyribózy. Dusíkaté báze jsou adenin, guanin, thymin a cytosin a jsou složeny ze dvou spirálovitě uspořádaných polynukleotidových řetězců. Adeninový pár s tymiinem a guaninový pár s cytosinem. Toto se označuje jako doplňkové párování bází.

Obrázek 02: Polynukleotid

Polynukleotidy, DNA i RNA, se přirozeně vyskytují v živých organismech a používají se v experimentech biologických i biochemických. Polynukleotidy se používají při PCR a DNA sekvenování. Mohou být syntetizovány pomocí oligonukleotidů. Pro syntézu a prodloužení polynukleotidového řetězce se přidají nové nukleotidy a řetězec se prodlouží přítomností polymerázových enzymů.

Jaké jsou podobnosti mezi oligonukleotidy a polynukleotidy?

• Oligonukleotidy a polynukleotidy jsou monomery DNA a RNA
• Oba jsou zapojeni do mnoha genetických technik včetně FISH a PCR.

Jaký je rozdíl mezi oligonukleotidy a polynukleotidy?

Oligonukleotid vs. polynukleotid
Oligonukleotid je fragment DNA nebo RNA, který se skládá z jednoho nebo více nukleotidových monomerů.	Polynukleotid je biopolymer, který se skládá z 13 nebo více nukleotidových monomerů.
Velikost
Oligonukleotid je kratší než polynukleotid.	Polynukleotid je delší než oligonukleotid.
Funkce
Oligonukleotidy se používají v genetických technikách, jako je FISH. PCR, DNA micro array.	Polynukleotidy se používají při FISH, PCR, sekvenování DNA atd.

Shrnutí - Oligonukleotidy vs. polynukleotidy

Nukleotidy jsou důležité biomolekuly, které se podílejí na hlavních metabolických funkcích v živých systémech. Jsou to monomery DNA i RNA. Nukleotidy jsou organické molekuly a jsou složeny ze tří základních podjednotek: dusíkaté báze, pentózového cukru a fosfátové skupiny. Oligonukleotidy a polynukleotidy jsou dva důležité typy nukleotidů. Obě molekuly jsou využívány v různých genetických technikách, včetně FISH a PCR. Oligonukleotidy se skládají z jednoho nebo více nukleotidových monomerů, zatímco polynukleotidy se skládají z 13 nebo více nukleotidových monomerů. Oligonukleotidy jsou kratší než polynukleotidy. To je rozdíl mezi oligonukleotidy a polynukleotidy.

Stáhněte si PDF verzi oligonukleotidů vs. polynukleotidů

Můžete si stáhnout PDF verzi tohoto článku a použít ji pro účely offline podle citace. Stáhněte si PDF verzi zde Rozdíl mezi oligonukleotidem a polynukleotidem

Reference:

1. Ohtsuka, E, et al. "Poslední vývoj v chemické syntéze polynukleotidů." Nucleic Acids Research, US National Library of Medicine, 11. listopadu 1982, k dispozici zde. Přístup k 31. srpnu 2017.
2. Mandal, MD Dr. Ananya. "Co je to oligonukleotid?" News-Medical.net, 10. září 2014, k dispozici zde. Přístup k 31. srpnu 2017

Obrázek se svolením:

1. „Antisense DNA oligonukleotid“ od Robinson R - RNAi Therapeutics: Jak je pravděpodobné, jak brzy? Robinson R PLoS Biology Vol. 2, č. 1, k dispozici zde (CC BY 2.5) na Commons Wikimedia
2. „Struktura DNA + klíč + označený.pn NoBB“ od Zephyris - vlastní práce (CC BY-SA 3.0) přes Commons Wikimedia