Rozdíl mezi Rho závislým a Rho nezávislým ukončením

klíčový rozdíl mezi Rho závislým a Rho nezávislým ukončením je to v Rho závislé zakončení, Rho faktor se váže s transkriptem a ukončí transkripci přerušením vodíkových vazeb mezi templátem a transkriptem, zatímco Rho nezávislé zakončení ukončí transkripci vytvořením struktury vlásenky a poté oblasti bohaté na U v transkriptu.

Transkripce je jedním ze dvou stupňů genové exprese. Je to proces, který produkuje sekvenci mRNA z genetické informace skryté v sekvenci DNA genu. Přepis probíhá třemi kroky: iniciace, prodloužení a ukončení. Enzym RNA polymerázy se váže na promotorovou sekvenci genu a začíná katalyzovat syntézu řetězce RNA. Dokud nenajde terminátorová sekvence, RNA polymeráza přidá nukleotidy a vytvoří RNA vlákno. V prokaryotech se ukončení děje prostřednictvím dvou hlavních strategií ukončení: Rho závislé ukončení a Rho nezávislé ukončení. Rho faktor je protein, který má helikázovou aktivitu.

OBSAH

1. Přehled a klíčový rozdíl
2. Co je Rho závislé ukončení
3. Co je Rho Nezávislé ukončení
4. Podobnosti mezi Rho závislým a Rho nezávislým ukončením
5. Srovnání bok po boku - Rho závislé vs. Rho nezávislé ukončení v tabulkové formě
6. Shrnutí

Co je Rho závislé ukončení?

Rho-dependentní ukončení je jedním ze dvou typů strategie ukončení transkripce vyskytujících se v prokaryotech. Rho faktor je protein, který má helikázovou aktivitu.

Obrázek 01: Rho závislé ukončení

Rho protein se váže s RNA transkriptem a pohybuje se podél RNA polymerázy ve směru 5'-3 ', což podporuje disociaci vodíkových vazeb mezi templátem DNA a RNA transkriptem. Když faktor Rho dosáhne transkripční bubliny, táhne hybrid DNA / RNA od sebe a uvolní transkript z transkripční bubliny. Pokud k tomu dojde, ukončí transkripci.

Co je Rho Nezávislé ukončení?

Rho nezávislé ukončení je druhá strategie, která ukončí prokaryotickou transkripci. Terminační oblast má obvykle invertovanou opakovací sekvenci. Ihned po převrácené opakovací sekvenci je oblast bohatá na adenin (AAAA). Když RNA polymeráza postupuje dopředu, vytváří sekvenci mRNA. Protože tyto dvě oblasti jsou komplementární v invertované opakované sekvenční oblasti, tvoří strukturu vlásenky smyčky díky vodíkové vazbě. Další oblastí bude oblast bohatá na U. Struktura vlásenky zastavuje aktivitu RNA polymerázy.

Obrázek 02: Rho Nezávislé ukončení

Kromě toho v oblastech bohatých na U existují slabé interakce mezi U bázemi transkriptu a A bázemi templátu. Tyto slabé vazby Adenin-Uracil destabilizují DNA templát a RNA transkript a vzájemně se oddělují. Nakonec se transkript uvolní z místa transkripce.

Jaké jsou podobnosti mezi Rho závislým a Rho nezávislým ukončením?

• Rho dependentní a Rho nezávislé ukončení jsou dvě hlavní terminační strategie nalezené v prokaryotech.
• Obě formy uvolňují transkript z DNA templátu k ukončení transkripce.

Jaký je rozdíl mezi Rho závislým a Rho nezávislým ukončením?

Rho dependentní zakončení je zprostředkováno Rho proteinem, zatímco Rho nezávislé zakončení nastává vytvořením struktury vlásenkové smyčky. Toto je klíčový rozdíl mezi Rho závislým a Rho nezávislým ukončením. Kromě toho Rho protein využívá energii ATP, zatímco Rho nezávislé ukončení nezahrnuje Rho protein a nevyužívá energii ATP. Proto je to také významný rozdíl mezi Rho závislým a Rho nezávislým zakončením.

Níže uvedený infographic ukazuje více srovnání souvisejících s rozdílem mezi Rho závislým a Rho nezávislým ukončením.

Shrnutí - Rho Dependent vs Rho Independent Termination

Rho závislé a Rho nezávislé ukončení jsou dva hlavní mechanismy ukončení transkripce vyskytující se v prokaryotech. Rho protein je zodpovědný za ukončení transkripce v Rho závislém ukončení. Naproti tomu Rho nezávislé zakončení nastává vytvářením struktury vlásenky. Toto je klíčový rozdíl mezi Rho závislým a Rho nezávislým ukončením.

Odkaz:

1. „Fáze přepisu“. Khan Academy, k dispozici zde.
2. „Vnitřní ukončení“. Wikipedia, Wikimedia Foundation, 8. února 2019, k dispozici zde.

Obrázek se svolením:

1. „Rho-dependent terminator“ Autor: Oalnafo1 - Vlastní práce (CC BY-SA 3.0) přes Commons Wikimedia
2. „Rho-independent terminator“ Autor: Ppgardne, anglický Wikipedia (CC BY-SA 3.0) prostřednictvím Commons Wikimedia