Rozdíl mezi cílenou a necílenou proteomikou

Klíčový rozdíl mezi cílenou a necílenou proteomikou je, že cílená proteomika se zaměřuje na měření hojnosti specifického proteinu, zatímco necílená proteomika necílí na konkrétní protein.

Proteomika je rozsáhlé studium proteinů, jejich struktur a funkcí. Studuje celý proteinový doplněk v buňce, tkáni nebo organismu za specifických podmínek. Existují dva typy proteomiky jako cílená proteomika a necílená proteomika.

OBSAH

1. Přehled a klíčový rozdíl
2. Co je to cílená proteomika
3. Co je necílená proteomika
4. Podobnosti mezi cílenou a necílenou proteomikou
5. Porovnání vedle sebe - cílené vs. necílené proteomiky v tabulkové formě
6. Shrnutí

Co je cílená proteomika?

Jak již název napovídá, cílená proteomika zacílí na analýzu specifický protein nebo peptid v komplexní směsi proteinů. Poté analyzuje přítomnost a množství předem zvoleného specifického proteinu. Tato metoda je možná pouze pro jeden vzorek nebo pro více vzorků. Tato metoda je vhodná i pro specifickou skupinu proteinů. Výsledkem jsou přesnější, kvantitativní a citlivější údaje. Navíc hmotnostní spektrometrie spojená s cílenou proteomikou poskytuje přesnější spolehlivá měření. Tato metoda používá pro analýzu trojitý kvadrupólový hmotnostní spektrometr (QQQ).

Obrázek 01: Proteomika

Cílená proteomika je vhodná metoda, pokud si chcete ověřit, zda je cílový knockdown skutečně zbořen, nebo pokud chcete kvantifikovat konkrétní protein / peptid v krevním séru, mozkové tekutině nebo v buněčném lyzátu atd. Můžete ho také použít, pokud chcete pro kontrolu, zda je konkrétní protein odlišně exprimován ve vzorcích nebo během experimentu s časovým průběhem.

Co je necílená proteomika?

Necílené proteomiky, jak název napovídá, nesměřují pro svou analýzu specifický protein nebo peptid. Objevte proteomiku je jiné jméno pro necílenou proteomiku. Ve skutečnosti jde o „globální“ analýzu. Obecně platí, že provádění necílených proteomik je odpovědět na otázku „jaký protein nebo proteiny jsou v tomto vzorku nebo ve více vzorcích?“. Tato metoda není citlivá jako cílená proteomika. Může však identifikovat a měřit mnoho proteinů včetně nových proteinů. Necílená proteomika může produkovat kvantitativní i kvalitativní měření.

Jaké jsou podobnosti mezi cílenou a necílenou proteomikou?

• Cílená i necílená proteomika měří proteiny ve vzorcích.
• Jsou důležité při analýze proteomu.
• Tyto metody používají hmotnostní spektrometrii.

Jaký je rozdíl mezi cílenou a necílenou proteomikou?

Za prvé, cílená proteomika je stanovení přítomnosti a množství konkrétního proteinu nebo peptidu v komplexní směsi proteinů. Naproti tomu necílená proteomika je kvantitativní a kvalitativní studie proteinů přítomných ve vzorku nebo vzorcích bez cílení na konkrétní protein. Cílená proteomika se provádí s předem vybranými nebo cílenými proteiny, zatímco za účelem zjištění typů proteinů v tomto vzorku se provádí necílená proteomika. Cílená proteomika je navíc citlivější než necílená proteomika.

Shrnutí - cílené vs. necílené proteomiky

Souhrnně lze říci, že cílená a necílená proteomika jsou dva typy proteinových studií. Jak jejich jména napovídají, cílená proteomika cílí na konkrétní protein, zatímco necílená proteomika necílí na konkrétní protein. To je rozdíl mezi cílenou a necílenou proteomikou.

Odkaz:

1. „Cílená proteomika.“ UC Davis Proteomics Core, k dispozici zde.
2. „Proteomika / Úvod do proteomiky“. Hudební teorie / režimy - Wikibooky, otevřené knihy pro otevřený svět, k dispozici zde.

Obrázek se svolením:

1. „Proteomika“ od Xxl7441 v anglických wikibookech - převedena z en.wikibooků na Commons (Public Domain) přes Commons Wikimedia