Rozdíl mezi Ti a Ri plazmidem

Klíčový rozdíl - Ti vs. Ri Plasmid
 

Agrobacterium je bakteriální rod, který způsobuje několik nemocí u dvouděložných rostlin včetně nemoci koronárních žlučníků a chlupatých kořenů. Tato dvě onemocnění jsou kódována geny umístěnými v plasmidech (ne chromozomální DNA) bakterií. Bakteriální druhy Agrobacterium tumerfaciens nese a plazmid indukující nádor (Ti plasmid), který je zodpovědný za chorobu žlučníku v rostlinách. Agrobacterium rhizogenes je další bakterie, která skrývá plasmid indukující kořeny (Ri plazmid) zodpovědný za chlup chlupatých kořenů v rostlinách. Plazmidy Ti a Ri jsou patogenní plazmidy jedinečné pro tento bakteriální rod. Klíčový rozdíl mezi Ti a Ri plazmidem je ten Ti plazmid je kódován geny zodpovědnými za způsobení onemocnění koronárních žláz, zatímco Ri plazmid je kódován geny pro chlupaté kořenové choroby v rostlinách. Tyto patogenní plazmidy obsahují klastry genů zodpovědné za replikaci DNA, virulenci, T-DNA, využití opinu a konjugaci. Během infekce, Agrobacterium vyřízne jeho T-DNA (transfer DNA) oblast plazmidu a integruje se s rostlinným genomem, aby způsobil nemoc. Tuto schopnost využívají molekulární biologové k zavedení důležitých genů do rostlin v genetickém inženýrství. Proto, Agrobacterium je považován za důležitý nástroj v biotechnologii a molekulární biologii pro zavedení chimérické DNA do různých druhů rostlin.

OBSAH
1. Přehled a klíčový rozdíl
2. Co je Ti Plasmid
3. Co je Ri Plasmid
4. Srovnání vedle sebe - Ti vs Ri Plasmid
5. Shrnutí

Co je Ti Plasmid?

Plazmid indukující nádor (Ti plazmid) je větší plazmid, který je skrývá Agrobacterium tumerfaciens způsobovat chorobu žlučníku v celé řadě dvouděložných rostlin. Název onemocnění koronální žluči se používá v důsledku tvorby velkých nádorů podobných otoků (gall) v koruně rostlin nad povrchem půdy v důsledku nadměrné produkce rostlinných hormonů auxinů a cytokininů A. tumerfaciens. Oblast T-DNA obsahuje geny vyvolávající nádor. Agrobacterium tumerfaciens vstupuje do rostlin přes poškozené rostlinné tkáně, zejména prostřednictvím ran, a přenáší svou část plazmidové DNA (T-DNA) spolu s geny způsobujícími onemocnění do rostlinných buněk. Tato T-DNA se poté integruje do genomu rostlinných buněk a přepisuje. Exprese genů způsobuje tvorbu nádorů a související změny metabolismu buněk. Crown gall disease nezpůsobuje vážné škody starším rostlinám. Snižuje se však kvalita školek.

Díky tomuto jedinečnému způsobu infekce, A. tumerfaciens se hojně používá jako nástroj v genetickém inženýrství pro produkci transgenních rostlin. Geny indukující nádor jsou potlačeny a požadované geny, jako jsou geny rezistentní na insekticidy a herbicidy, jsou vloženy nebo rekombinovány do Ti plazmidu za použití technologie rekombinantní DNA a použity v programech šlechtění rostlin. Když je T-DNA přenesena po infekci A. tumerfaciens na rostliny rostliny získávají účinky požadovaných genů přirozeně. Proto jakákoli cizí DNA vložená do T-DNA může být integrována do genomů rostlinných buněk pomocí procesu přirozené infekce této bakterie.

Obrázek 01: Ti plasmid z A. tumerfaciens

Co je Ri Plasmid?

Plazmid indukující kořeny (Ri Plasmid) je plazmid, který nese bakterie A. rhizogenes.  Ri plazmid je zodpovědný za onemocnění zvané chlupatá kořenová choroba v rostlinách dvouděložných rostlin. Infekce A. rhizogenes způsobuje rozsáhlou tvorbu náhodných kořenů v místě infekce nebo v jeho blízkosti. Geny vyvolávající chlupaté kořeny jsou umístěny v oblasti T-DNA Ri plazmidu. Plazmid Ri je větší plazmid podobný plazmidu Ti. A. rhizogenes je také schopný přenášet T-DNA oblast RI plazmidu do rostlinných buněk a integrovat se s genomem rostlinných buněk, aby se transkribovalo pomocí strojního vybavení rostlin k vyvolání nemocí. Proto plazmidy Ri také slouží jako důležité vektory v genetickém inženýrství rostlin.

Jaký je rozdíl mezi Ti a Ri Plasmidem??

Ti vs Ri Plasmid
Ti plazmid je kruhový a větší plazmid nesený A. tumerfaciens	Ri plazmid je kruhový a větší plazmid, který obsahuje A.rhizogenes
Choroba
Plazmid Ti kóduje geny pro onemocnění žlučníku v rostlinách	Ri plazmid kóduje geny pro chlupaté kořenové onemocnění v rostlinách dvouděložných rostlin.

Shrnutí - Ti vs Ri Plasmids

Plazmidy Ti a Ri jsou patogenní plazmidy nesoucí A. tumerfaciencs a A. rhizogenes, resp. Ti plazmid má geny indukující nádor, které způsobují onemocnění koronárních žláz v rostlinách. Ri plazmid má kořeny indukující geny, které způsobují chlupaté kořenové onemocnění v rostlinách. Toto je hlavní rozdíl mezi Ti a Ri plazmidy. Tyto plasmidy mohou být použity jako vektory v rostlinném genetickém inženýrství díky své přirozené schopnosti přenášet část své plazmidové DNA do hostitelského genomu. Obsahují klastry genů a jejich velikost je přibližně 200 kbp. Každý plazmid obsahuje jedinečné geny.

Reference
1. Katsunori Suzuki, Katsuyuki Tanaka, Shinji Yamamoto, Kazuya Kiyokawa, Kazuki Moriguchi a Kazuo Yoshida. 2. „Plazmy Ti a Ri.“ Springer. Springer Berlin Heidelberg, 1. ledna 1970. Web. 21. dubna 2017
3. Zupan, J.R. a P. Zambryski. "Přenos T-DNA z Agrobacterium do rostlinné buňky." Fyziologie rostlin. U.S. National Library of Medicine, duben 1995. Web. 22. dubna 2017

Obrázek se svolením:
1. „Ti plasmid“ od MouagipTento vektorový grafický obrázek byl vytvořen pomocí Adobe Illustrator. - Vlastní práce (CC0) přes Commons Wikimedia