Endonukleáza vs. exonukleáza
Endonukleáza a exonukleáza jsou enzymy nukleázy, které katalyzují hydrolýzu jednotlivých nukleotidů přítomných v řetězci DNA. Nukleázy hrají zásadní roli při analýze sekvence nukleotidů v DNA a RNA.
Exonuclease
Exonukleázové enzymy jsou kategorie enzymů, které se štěpí na nukleotidy na koncích molekuly DNA. Dva řetězce DNA se vzájemně doplňují. Jsou zastoupeny jako 3 'a 5' paže. Fosfodiesterové můstky DNA a RNA jsou napadeny dvěma třídami enzymů, které jsou reprezentovány jako „a“ a „b“. Enzymy skupiny „a“ specificky hydrolyzují esterovou vazbu mezi 3 'uhlíkem a fosforovou skupinu a enzymy skupiny „b“ hydrolyzují esterovou vazbu mezi 5' uhlíkem a fosforovou skupinou.
Dobrým příkladem exonukleázového enzymu skupiny „a“ je jed chřestýš a Russellina zmije. Tento jed hydrolyzuje všechny 3 'vazby v DNA nebo RNA uvolňující nukleotidové jednotky jako nukleosidové 5' fosfáty.
Enzymy třídy „b“ jsou reprezentovány fosfodiesterázou ve slezině, která hydrolyzuje všechny „b“ nebo 5 'vazby DNA a RNA a uvolňuje tak pouze nukleosidové 3' fosfáty..
Endonukleáza
Endonukleázové enzymy jsou enzymy, které se štěpí na vazby DNA z uvnitř molekuly. Nevyžadují volnou 3 'nebo 5' hydroxylovou skupinu na konci polynukleotidového řetězce. Endonukleázy útočí na specifické 3 'nebo 5' vazby, kdekoli se vyskytují v polynukleotidovém řetězci.
Endonukleázy jsou také rozděleny do skupin „a“ a „b“. Deoxyribonukleáza I hovězího pankreatu je kategorizována jako enzym třídy „a“, který katalyzuje hydrolýzu některých 3 'vazeb DNA za vzniku oligonukleotidů obsahujících průměrně asi čtyři nukleotidové zbytky.
Deoxyribonukleáza II je další endonukleáza třídy „b.“ Je izolován ze sleziny a brzlíku různých bakterií a způsobuje hydrolýzu 5 'vazeb, které vedou ke skupině nukleotidů.
Souhrn:
1. Exonukleáza způsobuje hydrolýzu nukleotidu na koncích, kde je v polynukleotidovém řetězci přítomna volná 3 'nebo 5' hydroxylová skupina, zatímco exonukleáza nevyžaduje volnou 3 'nebo 5' hydroxylovou skupinu, aby způsobila hydrolýzu polynukleotidového řetězce.
2. Výsledkem aktivity nukleonidů je nukleosid, zatímco aktivita endonukleázy vede k oligonukleotidům.
3.Výkon exonukleázy má za následek téměř okamžitě malé jednotky polynukleotidového řetězce, zatímco aktivita endonukleázy podléhá zpožděné fázi před uvolněním oligonukleotidových skupin..
4.Příjem jedu a fosfodiesterázy ze sleziny jsou příklady exonukleáz, zatímco deoxyribonukleáza I a II jsou příklady endonukleáz..