Al-Káida a Taliban jsou zřetelnými teroristickými skupinami extremistických muslimů, kteří nesprávně vykládají zásady
Al-Káida byla formálně organizována na konci 80. let několika vyššími islámskými vůdci, včetně Usámy bin Ládina, který poskytl velkou část svého financování. Začalo to jako džihádistická skupina (což znamená boj o Boží cestu) v Afghánistánu, známá jako Maktab al-Khidmat nebo „kancelář služeb“ proti Afgháncům a Sovětům, a později se vyvinula a rozšířila na globální džihádistické hnutí. Přestože se toto hnutí začalo v Afghánistánu, do konce roku 2008 byla velká většina členů Al-Káidy založena mimo zemi..
Začátek Talibanu se uvádí, že byl zahájen jako reakce proti válečníkům Mudžahedeenů a také sponzorován „afghánským tranzitním obchodem“, aby vyčistil jižní cestu napříč Afghánistánem. Někteří také navrhli, že Taliban také dostal podporu od CIA a ISI (Pákistánská zpravodajská agentura), aby bojoval proti Sovětům. Od roku 1994 do roku 1996 Taliban převzal kontrolu nad 34 provinciemi. V důsledku toho Taliban v Afghánistánu zavedl zákon šaríje a s pomocí náboženských vůdců v Pákistánu upevnil větší moc a uložil svá pravidla také v pohraničních oblastech Pákistánu.
Ideologie následovaná členy Al-Káidy je založena na právu šaría. Někteří navrhnou, že spisy Sayyad Qutb nebo qutbismus výrazně ovlivnili vedoucí představitele Al-Káidy. Podle qutbismu je islám způsob života a tato ideologie věří v koncept urážlivého džihádu, který je ozbrojeným bojem k podpoře islámu.
Ideologie následovaná Talibanem byla kombinací práva šaríje a paštunských kmenových kódů, sdílejících některé koncepty džihádu následované skupinou Al-Káida. Sledovali velmi přísný kodex chování, zakazovali televizi a videa a donutili muže a ženy, aby se řídili kodexem oblékání Talibanu a způsobem života Talibanu. Ideologie se však postupem času změnila a později byla většina rozhodnutí a zákonů přijímána a schvalována pouze samotným Mullahem Omarem.
Bylo provedeno celkem šest útoků Al-Káidy, čtyři proti Americe. Patří k nim bombový útok v Adenu v Jemenu v roce 1992, útok na Světové obchodní centrum v New Yorku a poté na konci 90. let na americkém velvyslanectví ve východní Africe, kde zahynulo 300 lidí. Nejničivější útok jako na Světové obchodní centrum v New Yorku 11. září 2001. Al-Káida se také podílela na útocích v Africe, Evropě, na Středním východě a v Kašmíru..
Taliban získal moc v roce 1994 zachycením města Kandahár a okolních oblastí. Taliban obdržel podporu od Pákistánského džihádu Ulema-e-Islam (JUI). Poté, co zajal Kabul v roce 1996, Taliban v Afghánistánu uvalil zákon šaría zakazující videozáznamy, tanec, ořezávání vousů muži a také donutil ženy oblékat si talibanský způsob a nosit burky. Tvrdá trestání byla uvalena na zloděje a vrahy „náboženskou policií“. Taliban působil v Afghánistánu a Pákistánu a jeho členové tvořili různé paštunské etnické kmeny a dobrovolníky z jiných hraničních islámských zemí.
Taliban bojuje také s dalšími náboženskými extremisty v Pákistánu. Například nedávný příběh BBC upozorňuje na útok Talibanu na militanty, kteří patří k Lashkar-e-islámu v oblasti Khyber.
Al-Káida je obecně považována za síť volně přidružených teroristických skupin, spíše než soudržnou organizaci se strukturou velení a řízení a trvalým kádrem teroristů. Ačkoli není k dispozici mnoho informací o Al-Káidě, představa Spojených států amerických o svědectví o organizaci a řízení provozu poskytla bývalý spolupracovník Usámy bin Ládina. Podle toho byla hlavní operace Al-Káidy řízena Usámou bin Ládinem a radil jí rada, která se skládá z 20–30 vedoucích členů Al-Káidy. Existují různé výbory, které jsou zřízeny pro správu oblastí, jako jsou vojenské operace, obchod, islámské právo a média.
Talibanská vláda byla popsána jako tajemná a diktátorská a klasifikována jako „alternativní vláda“. Nejsou žádné politické strany a neuskutečňují se volby. V čele Talibanu stojí Mullah Mohammed Omar a jeho velitelé jsou z velké části madrasa (vzdělávací instituce učící islám) učitelé. Několik soudů Sharie po celé zemi se zabývá obchodními a občanskými případy, včetně výběru daní.