Bakterie a viry vstupují do lidského těla a množí se, což způsobuje nemoci. Přestože bakteriální i virové infekce se liší podle postiženého orgánu, klíčový rozdíl mezi virovou a bakteriální infekcí spočívá v tom, že bakteriální infekce zvyšují počet neutrofilů a eozinofilů, zatímco viry zvyšují počet lymfocytů. Meningitida má horečku, bolesti hlavy, fotofobii, ztuhlost krku a zmatek. Sinusitida představuje bolest obličeje, horečku, rýmu, zablokovaný nos, post-nosní kapání a hlen. Zápal plic má kašel, produkci sputa, bolest na hrudi a horečka. Infekce močového ústrojí trpí horečkou, bolestí břicha, močí z krve a bolestivým močením.
Když bakterie nebo virus vstoupí do těla, narazí na ochranné mechanismy těla. Setká se to bílé krvinky, makrofágy, a dendritický buňky, které jej pohlcují a tráví. Tyto bakterie a viry obsahují molekuly, které jsou komplexním receptorovým systémem v těle identifikovány jako cizí látky. To spouští komplexní řadu reakcí určených ke zničení cizích látek. Jakmile je prvních několik bakterií štěpeno, jejich cizí proteiny se dostanou přichycené k buněčné membráně buněk, které je štěpily. Tyto proteiny se spouštějí B a T lymfocyty. B lymfocyty tvoří protilátky a T lymfocyty tvoří toxické látky určené k ničení útočníků. Systém komplementu se aktivuje a vytváří také membránu, která se váže na membránu bakteriálních buněk, což vede k její destrukci. Když jsou buňky poškozeny toxickými látkami uvolňovanými ochrannými buňkami, akutní zánět začíná. Pokud je organismus virulentní, dojde k velké reakci. Pokud organismus přetrvává, absces může dojít k tvorbě a chronickému zánětu. Pokud reakce odstraní organismus nebo léčba drogy narušuje přirozený průběh nemoci, bude následovat uzdravení s rozlišením nebo zjizvení.
Baktérie jsou jednobuněčné organismy. Mají buněčná membrána, organely, a jádro. Spotřebovávají substráty a kyslík a produkují energii. Rozmnožují se a vytvářejí. Mohou to být komenzály, které žijí v harmonii, aniž by způsobovaly příznaky, a patogeny které způsobují nemoci. Mezi komenzály existují organismy, které způsobují nemoci, pokud k tomu dojde. Nazývají se oportunní patogeny.
Bakteriální infekce přítomné podle závažnosti infekce. Bakteriální infekce vede k uvolnění specifických zánětlivých mediátorů. Extracelulární bakterie vyvolávají migraci neutrofily. Plný krevní obraz tedy vykazuje vysoký počet neutrofilů. Intracelulární bakterie spouští eozinofily i neutrofily, a proto celkový krevní obraz vykazuje zvýšené množství těchto buněk. Počet červených krvinek může být relativně nízký. Některá bakteriální onemocnění způsobují anémii. Destička počet zůstává ve většině případů normální.
Viry jsou mikroskopické formy života s a nukleová kyselina pramen, protein jádro a kapsle. Jsou to jednoduché organismy, které potřebují buňku k prosperitě a množení. Existují RNA viry a DNA viry. Viry DNA začleňují svou DNA přímo do buněčného replikačního systému a vytvářejí si kopie. RNA viry produkují kompatibilní vlákno DNA ze své RNA s reverzní transkripcí a začleňují ji do buněčných mechanismů, aby vytvořily její kopie. (Číst Rozdíl mezi replikací DNA a transkripcí)
Když viry vstupují do buněk, některé z nich se štěpí a cizí proteiny se dostanou přichytit na buněčnou membránu hostitelských buněk. To vyvolává tělesné reakce proti virům. Lymfocyty převažují v reakci proti virům. Některé viry inhibují funkci kostní dřeně a omezují tvorbu buněk. Počet bílých krvinek, počet krevních destiček a počet červených krvinek proto může u virových infekcí poklesnout. Některé viry zvyšují permeabilitu cév a způsobují únik tekutin.
Bakterie jsou jednobuněčné organismy, zatímco viry jsou primitivnější.
Bakteriální infekce zvyšují počet neutrofilů a eozinofilů, zatímco viry zvyšují počet lymfocytů.