Agaróza a polyakrylamid jsou oba ve vodě rozpustné polymery, ale mezi nimi lze pozorovat mnoho rozdílů, počínaje jejich původem. Agaróza i polyakrylamid mají něco společného ve své schopnosti vytvářet porézní gelové matrice. Navzdory tomu existuje mezi oběma očima několik výrazných rozdílů. Hlavní rozdíly mezi oběma těmito polymery spočívají v jejich povaze původu, chemické struktuře, jejich různých použitích a jejich výkonnosti z hlediska gelové elektroforézy..
Agaróza je přirozeně se vyskytující lineární polymer, který je zase odvozen od komplexního polymeru zvaného agar, který se nachází v mořských řasách. Agaróza je extrahována z agaru odstraněním její proteinové složky zvané agaropectin. Agaróza je to, co dává agaru jeho schopnost tvořit gely.
Hlavní využití agarózy je v mikrobiologických a molekulárně biologických studiích. V mikrobiologických studiích poskytuje agaróza po doplnění vhodnými živinami pevný základ pro kultivaci mikroorganismů, jako jsou bakterie a houby. Při použití v polotuhých koncentracích může být užitečné při posuzování pohyblivosti těchto mikroorganismů. V molekulární biologii slouží jako důležitý nástroj pro jeden z nejzákladnějších procesů rozlišení, který se nazývá „Gelová elektroforéza„nebo“elektroforéza na agarózovém gelu'(AGE). Gelová elektroforéza je proces, který umožňuje štěpení nebo separaci nukleových kyselin nebo proteinu na základě jejich velikosti a náboje. Agaróza zde slouží jako porézní gel podobný sítu, kterým dochází k oddělení.
Struktura agarózy
Polyakrylamid je syntetický polymer a používá se v celé řadě průmyslových odvětví. Jak již bylo zmíněno, jeho použití se spoléhá na jeho schopnost tvořit gely. Kromě toho je však v různých průmyslových odvětvích využívána i jeho schopnost zadržovat a vypouštět vodu v různých koncentracích.
Nejrozšířenější a polyakrylamid se běžně používá při čištění odpadních vod. Zde se používá jako flokulační činidlo k odstranění veškerého suspendovaného organického materiálu; proto, zlepšení zákalu a čištění vody. Další použití polyakrylamidu je v papírenském průmyslu. Zde se používá buď k zadržování nebo vypouštění vody z papírové buničiny podle potřeby. Podobně se v zemědělském a stavebním průmyslu používá jako půdní kondicionér k zabránění erozi půdy a ke zlepšení její kvality.
Stejně jako agaróza se i polyakrylamid používá v molekulární biologii jako důležitý nástroj pro rozlišení v podobném procesu zvaném „Elektroforéza na polyakrylamidovém gelu “(PAGE). Kromě toho všeho se polyakrylamid také používá při zpracování rudy a výrobě flokulačního činidla k odstranění veškerého suspendovaného organického materiálu; proto, zlepšení zákalu a čištění vody. Další použití polyakrylamidu je v papírenském průmyslu. Zde se používá buď k zadržování nebo vypouštění vody z papírové buničiny podle potřeby. Podobně se v zemědělském a stavebním průmyslu používá jako půdní kondicionér k zabránění erozi půdy a ke zlepšení její kvality. Kromě toho se polyakrylamid používá také při výrobě potravinářských přídatných látek, měkkých kontaktních čoček a textilu.
Polyakrylamidová struktura
Agaróza: Agaróza je polymer přírodního původu. Pochází z mořských řas.
Polyakrylamid: Polyakrylamid je syntetického původu a není nalezen za žádných přírodních okolností.
Agaróza: Molekulární vzorec agarózy je C24H38Ó19.
Polyakrylamid: Molekulární vzorec polyakrylamidu je (C 3H5NE)n.
Agaróza: Agaróza je lineární polysacharid. Skládá se z opakujících se disacharidových jednotek zvaných agrobióza, které jsou drženy pohromadě vodíkovými vazbami.
Polyakrylamid: Polyakrylamid je chemicky zesítěný polymer. Je vyroben z akrylamidových monomerů a síťovadla N, N'-methylenbisakrylamidu..
Agaróza: Jak agaróza, tak její monomerní jednotka agrobiózy jsou v přírodě netoxické.
Polyakrylamid: Monomerní jednotka polyakrylamidu, akrylamidu, je předpokládaným karcinogenem a známým neurotoxinem, zatímco jeho polymerizovaná forma je v přírodě netoxická.
Agaróza: Příprava agarózového gelu pro AGE je méně časově náročná, snadná a jednoduchá a nevyžaduje iniciátor nebo polymerační katalyzátor.
Polyakrylamid: Polyakrylamidový gelový přípravek pro PAGE je časově náročný a zdlouhavý a vyžaduje také iniciátor (persíran amonný) a polymerizační katalyzátor (N, N, N ', N'-tetramethylethylendiamin - TEMED).
Polyakrylamidové gely jsou chemicky stabilnější než agarózové gely.
Při stejné koncentraci mají polyakrylamidové gelové matrice tendenci mít menší velikost pórů ve srovnání s agarózovou gelovou matricí.
Velikost pórů polyakrylamidových gelů může být změněna kontrolovanějším způsobem než velikost agarózových gelů.
Polyakrylamidové gely mají vysokou rozlišovací schopnost, zatímco agarózové gely mají nízkou rozlišovací schopnost.
Polyakrylamidové gely mohou pojmout větší množství nukleové kyseliny než agarózové gely pro rozlišení.
Snímek se svolením: Agaróza a struktura polyakrylamidu prostřednictvím Wikicommons (Public Domain)