Agaróza vs. polyakrylamid
Existují různé rozdíly týkající se agarózy a polyakrylamidu, včetně jejich fyzické struktury, toxicity a způsobů jejich odlévání, jakož i jejich ceny. Je užitečné znát tyto rozdíly a jejich podobnosti, pokud jednáte s některým z těchto typů gelů.
Jedním z hlavních rozdílů mezi těmito dvěma gely je to, že agaróza se nalije vodorovně, zatímco polyakrylamid se nalije svisle. Je mnohem snazší nalévat agarózou tímto horizontálním způsobem. Agaróza může být zahřívána, aby napomohla procesu lití, ačkoli by neměla být zahřívána do tak rozsáhlé míry, že agaróza končí táním. Také se může rozhodnout, zda použít úzké nebo široké pruhy k nalití agarózy. Může být nalita pomocí tohoto způsobu drážkování, a to je jedna z jeho výhod. Při nalévání byste měli být velmi opatrní, protože agaróza je velmi jemná a snadno se zlomí.
Na druhé straně, jak již bylo zmíněno, polyakrylamid je nalit svisle. Polyakrylamid potřebuje pro tento proces skleněné desky, protože jeho struktura je velmi tenká a je nutná tato další podpora. Na rozdíl od agarózy nemůže být polyakrylamid znovu zahříván a potom nalit.
Agaróza sestává z mnoha molekul, zatímco polyakrylamid obecně sestává pouze z jedné velké molekuly. Molekuly agarózy jsou drženy pohromadě intermolekulárními silami a molekuly jsou tvořeny DNA. Existují velké a malé molekuly a obecně jsou větší molekuly snadněji odděleny než menší molekuly. Molekula polyakrylamidu je tvořena DNA nebo proteinem. Mezery mezi gely polyakrylamidu jsou menší než mezery mezi gely agarózy, což je další rozdíl mezi těmito dvěma látkami. Pokud je velikost proužků stejná v agaróze, existují různé velikosti proužků v polyakrylamidu. Pokud je molekula polyakrylamidu vystavena vzduchu, neztuhne rovnoměrně, protože vzduch polymerizuje proces polymerizace.
Pokud jde o toxicitu, agaróza se považuje za netoxickou látku. Zatímco polyakrylamid je považován za stejný, jeho prášek je považován za toxický a je rozumné manipulovat s gely ochrannými opatřeními.
Polyakrylamid se používá pro sekvenování gelů a proteinových gelů. Jeho výhody spočívají v tom, že má snadné barvicí vlastnosti a může být sušen za vzniku gelu. Je zakoupeno předem a je levnější než agaróza, asi 5 $ 7 'na gel. (Agaróza je asi 1 $ na gram). Osobě se doporučuje, aby měla dostatečné zkušenosti před zakoupením jednoho z těchto dvou gelů, protože před každým nákupem musí být znám počet potřebných vzorků a potřebná koncentrace gelu..
Souhrn:
1.Agaróza se nalije vodorovně, zatímco polyakrylamid se nalije svisle.
2.Agaróza je dražší než polyakrylamid.
3.Agaróza se skládá z mnoha molekul, zatímco polyakrylamid se skládá pouze z jedné velké molekuly.
4. Na rozdíl od polyakrylamidu lze agarózu znovu zahřát.
5.Agaróza je považována za netoxickou látku ve všech svých formách, zatímco prášek polyakrylamidu je považován za toxický.