Peptid vs. protein
Aminokyseliny, peptidy a proteiny jsou často označovány jako příbuzné termíny, přesto se liší svými vlastnostmi. Aminokyseliny jsou stavební kameny peptidů i proteinů. Aminokyselina je malá molekula, která obsahuje aminoskupinu (-NH)2) a skupinu karboxylové kyseliny (-COOH), které jsou vázány na centrální atom uhlíku, s dalším vodíkem a postranním řetězcem (skupina R-). Tento postranní řetězec se u všech aminokyselin liší; proto určuje jedinečné znaky a chemii každé aminokyseliny. Konkrétní genová sekvence se používá ke stanovení aminokyselinové sekvence jak v peptidu, tak v proteinech.
Peptid
Peptidy jsou tvořeny dvěma nebo více aminokyselinami, spojenými peptidovými vazbami a jsou přítomny jako lineární řetězce. Délka peptidu je určena množstvím aminokyselin v něm. Délka peptidu je obvykle menší než přibližně 100 aminokyselin.
Předpony se používají k popisu typu peptidů v obecné terminologii. Například, když je peptid tvořen dvěma aminokyselinami, nazývá se dipeptid. Podobně se tři aminokyseliny kombinují za vzniku tripeptidů, čtyři aminokyseliny se kombinují za vzniku tetrapeptidů atd. Kromě těchto typů existují oligopeptidy (tvořené 2 až 20 aminokyselinami) a polypeptidy, které mají mnoho peptidů (méně) než 100). Nejdůležitější charakteristické znaky peptidů jsou určeny množstvím a sekvencí aminokyselin.
Primární funkcí většiny peptidů je umožnit efektivní komunikaci přenášením biochemických zpráv z jednoho místa na druhé v těle.
Protein
Proteiny jsou nejrozmanitější skupinou biologických makromolekul. Protein je složen z jednoho nebo více dlouhých nerozvětvených řetězců nazývaných polypeptidy, a přesto jsou stavebními bloky proteinů aminokyseliny. Sekvence aminokyselin určuje hlavní charakteristiky proteinu, zatímco tato aminokyselinová sekvence je definována konkrétní genovou sekvencí.
Proteiny obvykle mají stabilní trojrozměrné struktury. O těchto strukturách lze hovořit v hierarchii čtyř úrovní; primární, sekundární, terciární a kvartérní. Primární struktura je aminokyselinová sekvence proteinu. Sekundární struktura je produkována vytvářením vodíkových vazeb mezi dvěma blízkými aminokyselinami, čímž vznikají struktury nazývané p-plátované listy a cívky nazývané a-helixy. Oblasti sekundární struktury jsou pak složeny dále v prostoru, aby se vytvořily konečné trojrozměrné struktury proteinu. Uspořádání více polypeptidů v prostoru vede ke kvartérní struktuře proteinu.
Hlavní funkce proteinů jsou enzymová katalýza, obrana, transport, podpora, pohyb, regulace a skladování.
Jaký je rozdíl mezi peptidem a proteinem??
• Peptidy jsou krátké lineární řetězce aminokyselin, zatímco proteiny jsou velmi dlouhé řetězce aminokyselin.
• Několik aminokyselin je spojeno dohromady za vzniku peptidu peptidovými vazbami, zatímco několik peptidů je spojeno dohromady za vzniku molekul proteinu.
• Normálně mají proteiny stabilní trojrozměrné struktury. Naproti tomu peptidy nejsou organizovány ve stabilní trojrozměrné struktuře.
• Délka peptidu je menší než přibližně 100 aminokyselin, zatímco délka proteinu je více než 100 aminokyselin. (Existují výjimky; rozdíly se tak spoléhají spíše na funkci molekul, než na jejich velikost)
• Na rozdíl od peptidů jsou proteiny považovány za makromolekuly.
• U peptidů tvoří vodíkové vazby pouze postranní řetězce aminokyselin. Zatímco v proteinech vytvářejí vodíkové vazby nejen postranní řetězce, ale také peptidové skupiny. Tyto vodíkové vazby mohou být s vodou nebo s jinými peptidovými skupinami.
• Všechny peptidy existují jako lineární řetězce, zatímco proteiny mohou existovat jako primární, sekundární, terciární a kvartérní.