Rozdíl mezi RNASE A a RNASE H

Klíčový rozdíl - RNASE A vs. RNASE H
 

Ribonukleázy jsou nukleázy, které specificky degradují RNA na menší jednotky. Lze je rozdělit do dvou kategorií; endoribonukleázy a exoribonukleázy. Endoribonukleáza je endonukleáza, která může degradovat jednořetězcovou nebo dvouřetězcovou RNA. Štěpí fosfodiesterové vazby v RNA polynukleotidovém řetězci. Příklady jsou RNáza A, RNáza III, RNáza Tl, RNáza P a RNáza H. Exoribonukleáza je exonukleáza, která degraduje RNA odstraněním terminálních nukleotidů buď z 5 'nebo 3' konce molekuly RNA. Příklady jsou RNáza R, RNáza II, RNáza D a RNáza PH. klíčový rozdíl mezi RNASE A a RNASE H je to RNáza A je pankreatická ribonukleáza, která specificky degraduje jednovláknovou RNA na menší složky, zatímco RNáza H je nespecifický enzym, který štěpí RNA v hybridě RNA-DNA na menší jednotky prostřednictvím hydrolytického mechanismu.

OBSAH

1. Přehled a klíčový rozdíl
2. Co je RNASE A
3. Co je RNASE H
4. Podobnosti mezi RNASE A a RNASE H
5. Porovnání bok po boku - RNASE A vs. RNASE H v tabulkové formě
6. Shrnutí

Co je RNASE A?

RNáza A je pankreatická ribonukleáza, která specificky štěpí nepárové zbytky cytosinu a uracilu na 3 'konci jednořetězcové RNA. RNáza H pracuje při vyšší koncentraci soli (0,3 M nebo vyšší koncentrace NaCl). Hydrolytická reakce je dva kroky. Vytváří 3 'fosforylovaný produkt prostřednictvím 2', 3 'cyklického monofosfátového meziproduktu. Přestože je specifická pro jednovláknovou RNA při vyšší koncentraci soli, může také degradovat dvouvláknovou RNA a RNA v hybridě RNA-DNA při nižší koncentraci NaCl (nižší než 0,3M NaCl)..

Bruce Merrifield poprvé syntetizoval tento enzym. RNáza A je velmi populární enzym v molekulárním výzkumu. Hovězí pankreatická RNáza A je příkladem RNázy A. A je to jeden z nejtěžších enzymů, které se v laboratoři používají. Tento enzym pro svou aktivitu nepotřebuje kofaktor. Je to vysoce termostabilní enzym. RNáza A je první enzym a třetí protein, u kterého byla detekována správná aminokyselinová sekvence. Tento enzym je velmi malý se 124 aminokyselinami a molekulovou hmotností 12600da. A má čtyři histidinové zbytky (His 12 a His 119, které se účastní katalytické reakce).

Obrázek 01: RNáza A

RNázu A lze izolovat vařením surového vzorku. Když vaří, všechny ostatní enzymy degradují zbývající RNázu A. RNáza A je neuvěřitelně stabilní enzym. Tento enzym inhibuje proteiny inhibitoru ribonukleázy, komplexy těžkých kovů a uridin vanadátu.

Co je RNáza H?

RNáza H je nespecifický ribonukleázový enzym, který může degradovat RNA v hybridě RNA-DNA hydrolytickou reakcí. RNáza H štěpí 3'-O-P vazbu RNA v hybridu RNA-DNA. Nakonec vyrábí 3'OH a 5'fosfátové produkty. V replikaci DNA hraje klíčovou roli tím, že odstraní RNA primer po vytvoření nových řetězců DNA. V laboratorních podmínkách specificky degraduje RNA v RNA-DNA hybrid, ale ne DNA a nehybridizovanou RNA. Tento enzym se obvykle používá ke zničení templátu RNA poté, co se během syntézy cDNA vytvoří první vlákno komplementu DNA.

Obrázek 02: RNáza H

RNáza H se také používá v testech na ochranu nukleáz. Může být také začleněn do odstranění poly A konce z mRNA. RNáza H má schopnost ničit nekódující RNA uvnitř a vně buňky. Kovové ionty jsou vyžadovány jako kofaktory pro tuto proteinovou aktivitu. Chelátor (EDTA) lze použít k inhibici enzymu RNázy H.

Jaké jsou podobnosti mezi RNASE A a RNASE H?

• Oba jsou proteinové povahy.
• Oba jsou endoribonukleáza
• Oba mohou degradovat RNA.
• Oba provádějí hydrolytické reakce.
• Molekulární laboratoře používají oba tyto.

Jaký je rozdíl mezi RNASE A a RNASE H?

RNASE A vs. RNASE H
RNáza A je pankreatická ribonukleáza, která specificky štěpí 3 'konec nepárových zbytků cytosinu a uracilu jednovláknové RNA při vyšší koncentraci soli.	RNáza H je nespecifický ribonukleázový enzym, který může degradovat RNA v hybridě RNA-DNA hydrolytickou reakcí.
Povaha štěpení RNA
RNáza A specificky štěpí jednovláknovou RNA při vyšší koncentraci soli.	RNáza H štěpí RNA v RNA-DNA hybrid.
Potřeba kofaktorů pro aktivitu
RNáza A pro svou aktivitu nepotřebuje kofaktory.	RNáza H potřebuje pro svou aktivitu kovové ionty jako kofaktory.
Inhibitory proteinové aktivity
Protein inhibitoru ribonukleázy, komplexy těžkých kovů a uridin vanadátu inhibují aktivitu RNAsy A.	Chelátor (EDTA) inhibuje aktivitu RNázy H.
Odstranění primeru RNA v replikaci DNA
RNáza A se nepoužívá pro odstranění RNA primerů při replikaci DNA.	RNáza H se používá pro odstranění primeru RNA při replikaci DNA
Odstranění šablony DNA v syntéze komplementární DNA (C-DNA)
RNáza A se nepoužívá pro odstranění templátu RNA během syntézy komplementární DNA (C-DNA).	RNáza H se používá k odstranění templátu RNA během syntézy komplementární DNA (C-DNA).
Odstranění poly-A-ocasu v mRNA hybridizované na Oligo (dt)
RNáza A se nepoužívá k odstranění „poly-A ocasu“ v mRNA hybridizované k oligo (dt).	RNáza H se používá k odstranění „poly-A ocasu“ v mRNA hybridizované k oligo (dt)

souhrn - RNASE A vs. RNASE H

Ribonukleázy jsou nukleázové enzymy, které mají schopnost štěpit RNA na menší jednotky. Jsou to dva typy; endoribonukleázy a exoribonukleázy. Endoribonukleáza je endonukleáza, která má schopnost degradovat jednovláknovou nebo dvouvláknovou RNA. A štěpí fosfodiesterovou vazbu v RNA polynukleotidovém řetězci. RNáza A a RNáza H jsou dvě endoribonukleázy. RNáza A je pankreatická ribonukleáza, která specificky štěpí nepárové zbytky cytosinu a uracilu na 3 'konci jednořetězcové RNA při vyšší koncentraci soli. RNáza H je nespecifický ribonukleázový enzym, který může degradovat RNA v hybridě RNA-DNA hydrolytickou reakcí. Toto je rozdíl mezi RNázou A a RNázou H.

Stáhněte si PDF RNASE A vs. RNASE H

Můžete si stáhnout PDF verzi tohoto článku a použít ji pro účely offline podle citace. Stáhněte si PDF verzi zde Rozdíl mezi RNASE A a RNASE H

Odkaz:

1.Karuturi, autor Amrutha. "17 potřebuje znát fakta o RNase A." AG Blog, 22. února 2017. K dispozici zde
2. „Ribonukleáza.“ Wikipedia, Wikimedia Foundation, 5. ledna 2018. K dispozici zde  

Obrázek se svolením:

1.'RNase A'By Nebyl poskytnut žádný strojově čitelný autor. Vossman převzal (na základě nároků na autorská práva)., (CC BY-SA 2.5) prostřednictvím Commons Wikimedia
2.'RNase H fix'By Nebyl poskytnut žádný strojově čitelný autor. Vossman převzal (na základě nároků na autorská práva)., (CC BY-SA 2.5) prostřednictvím Commons Wikimedia