Rozdíl mezi Watsonem a Crickem a Hoogsteenovým párováním bází

klíčový rozdíl mezi Watsonem a Crickem a Hoogsteenem je párování bází Watsonovo a Crickovo párování bází je standardní způsob, který popisuje tvorbu párů bází mezi puriny a pyrimidiny. Mezitím je Hoogsteen párování bází alternativním způsobem vytváření párů bází, ve kterém purin má odlišnou konformaci s ohledem na pyrimidin.

Nukleotid má tři složky: dusíkatou bázi, pentózový cukr a fosfátovou skupinu. Do struktury DNA a RNA je zapojeno pět různých dusíkatých bází a dva pentózové cukry. Když tyto nukleotidy tvoří nukleotidovou sekvenci, tvoří komplementární báze, buď puriny nebo pyrimidiny, vodíkové vazby mezi nimi. Toto je známé jako párování bází. Proto je pár bází vytvořen spojením dvou dusíkatých bází vodíkovými vazbami. Watsonovo a Crickovo párování bází je klasický nebo standardní přístup, zatímco párování bází Hoogsteen je alternativní způsob vytváření párů bází.

OBSAH

1. Přehled a klíčový rozdíl
2. Co je Watson a Crick Base Pairing
3. Co je to základní párování Hoogsteen
4. Podobnosti mezi párováním Watson a Crick a Hoogsteen
5. Srovnání bok po boku - Watson a Crick vs Hoogsteen párování bází v tabulkové formě
6. Shrnutí

Co je Watson a Crick Base Pairing?

Watsonovo a Crickovo párování bází je standardní metoda, která vysvětluje párování bází dusíkatých bází v nukleotidech. James Watson a Francis Crick v roce 1953 vysvětlili tuto základní metodu syntaktické analýzy, která stabilizuje dvojnásobné standardní helixy DNA. Podle Watsonova a Crickova párování bází tvoří adenin vodíkové vazby s thyminem v DNA a uracilem v RNA. Navíc guanin vytváří vodíkové vazby s cytosinem v DNA i RNA.

Obrázek 01: Watson a Crick Base Pairing

Existují tři vodíkové vazby mezi G a C, zatímco existují dvě vodíkové vazby mezi A a T. Tyto páry bází umožňují šroubovici DNA udržovat svou pravidelnou spirálovitou strukturu. Většina nukleotidových sekvencí (60%) má Watsonovy a Crickovy páry bází, které jsou stabilní při neutrálním pH.

Co je Hoogsteen Base Pairing?

Hoogsteen párování bází je alternativní způsob, jak vytvořit páry bází v nukleových kyselinách. Poprvé to popsal americký biochemik Karst Hoogsteen v roce 1963. Dvojice bází Hoogsteen jsou podobné párům bází Watson a Crick. Vyskytují se mezi adeninem (A) a tyminem (T) a guaninem (G) a cytosinem (C). Ale purin má odlišnou konformaci, pokud jde o pyrimidin. V páru bází A a T se adenin otáčí o 180 °⁰ o glykosidické vazbě, což umožňuje alternativní schéma vodíkové vazby. Podobně v páru G a C se guanin otáčí o 180 ° kolem glykosidické vazby. Kromě toho je úhel glykosidických vazeb větší v Hoogsteenových párech bází. Kromě toho tvorba párů bází Hoogsteen není stabilní při neutrálním pH.

Obrázek 02: Watson a Crick Base Pairing vs. Hoogsteen Base Pairing

Hoogsteenovy páry bází jsou nekanonické páry bází, díky nimž jsou nukleotidové sekvence méně stabilní než standardní párování bází. Navíc mohou vést k narušení dvojité šroubovice DNA. Ačkoli se páry bází Hoogsteen vyskytují přirozeně, jsou velmi vzácné.

Jaké jsou podobnosti mezi párováním Watson a Crick a Hoogsteen Base?

• Watson a Crick a Hoogsteen párování bází jsou dva způsoby, jak popsat tvorbu párů bází v nukleových kyselinách.
• Oba se přirozeně vyskytují v DNA.
• Navíc existují ve vzájemné rovnováze.
• Dvojice bází jsou v obou metodách podobné.

Jaký je rozdíl mezi Watsonem a Crickem a Hoogsteenovým párováním bází?

Watsonovo a Crickovo párování bází je standardní způsob, který popisuje tvorbu párů bází mezi puriny a pyrimidiny. Na druhé straně, párování bází Hoogsteen je alternativní způsob vytváření párů bází, ve kterých purin má odlišnou konformaci s ohledem na pyrimidin. Toto je klíčový rozdíl mezi párováním bází Watson a Crick a Hoogsteen. Párování bází Watson a Crick bylo popsáno Jamesem Watsonem a Francisem Crickem v roce 1953, zatímco párování bází Hoogsteenu bylo popsáno Karstem Hoogsteenem v roce 1963. Navíc jsou páry bází Watson a Crick stabilní, zatímco páry bází Hoogsteen jsou obvykle méně stabilní.

Níže uvedený infographic shrnuje rozdíl mezi párováním bází Watson a Crick a Hoogsteen.

Shrnutí - Watson a Crick vs Hoogsteen Base Pairing

Watsonovo a Crickovo párování bází a Hoogsteenovo párování bází jsou dva typy způsobů, které popisují tvorbu dusíkatých bází v nukleotidových sekvencích. Při párování bází Hoogsteen má purinová báze odlišnou konformaci s ohledem na pyrimidinovou bázi. Toto je klíčový rozdíl mezi párováním bází Watson a Crick a Hoogsteen. Navíc páry bází Watson a Crick stabilizují dvojitou spirálu DNA, zatímco páry bází Hoogsteen činí spirálu nestabilní. Oba typy párů bází se však vyskytují přirozeně a existují ve vzájemné rovnováze.

Odkaz:

1. „Základní pár Hoogsteen.“ Wikipedia, Wikimedia Foundation, 9. ledna 2020, k dispozici zde.
2. „Objev struktury a funkce DNA: Watson a Crick.“ Nature News, Nature Publishing Group, k dispozici zde.

Obrázek se svolením:

1. „GC Watson Crick basepair“ Autorem původního uploaderu byla společnost WillowW na anglické Wikipedii. - Převedeno z en.wikipedie na Commons (CC BY-SA 3.0) přes Commons Wikimedia
2. „Hoogsteen Watson Crick pairing-cs“ od Iana Fursta - vlastní práce (CC BY-SA 4.0) přes Commons Wikimedia